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nodding木蟲 (小有名氣)
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[求助]
怎么輸出 原子中核心電子的空間分布文件？
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誠摯請教各位： 怎么輸出 原子中核心電子的空間分布文件？ 我想利用 cube=（orbitals, Cards）orbitals 中 all - valence 來處理， 但遇到以下幾個問題： 1、 all 所有分子軌道，包括占據(jù)軌道和空軌道吧。valence 是指所有占據(jù)的非核分子軌道， all-valence 是核心原子的軌道嗎？ 2、由于 all 所有分子軌道 和 valence 分子軌道，文件大小不一，沒法用cubman 相減，又該如何處理？ 3、能否用 cube=（density, Cards）來得到 核心電子空間分布文件。 真誠向各位請教。謝謝。 |
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sobereva
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【答案】應(yīng)助回帖
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nodding: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-11-20 14:42:44
cenwanglai: 金幣+3, 謝謝回復(fù)~ 2012-11-20 19:05:35
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用Multiwfn可以很容易地實現(xiàn)此目的，過程清晰得多。 比如對于B3LYP/6-31G**下的乙酸，共80個軌道，由于有四個第二周期的原子，所以前4個是內(nèi)核軌道。啟動Multiwfn，依次輸入 aceticacid.fch //相應(yīng)的fch文件 6 //修改波函數(shù) 26 //設(shè)置占據(jù)數(shù) 5-80 //選擇5到第80號軌道，即所有非內(nèi)核軌道 0 //設(shè)占據(jù)數(shù)為0�，F(xiàn)在只剩內(nèi)核電子了 q -1 //退回到主菜單 5 //計算格點(diǎn)數(shù)據(jù) 1 //電子密度 2 //中等質(zhì)量格點(diǎn)。也可以用其它的設(shè)定 2 //輸出cube文件到當(dāng)前目錄下density.cub。此即乙酸的內(nèi)核電子的密度。 Multiwfn也可以直接讀取cube文件，然后在主功能13里通過選項11來使之與其它的cube文件相互運(yùn)算。cubman的功能是Multiwfn主功能13的選項11的功能的子集。 |
2樓2012-11-20 14:30:36
nodding
木蟲 (小有名氣)
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3樓2012-11-20 14:41:22
nodding
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4樓2012-11-21 11:28:27
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