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mdcrd文件出現(xiàn)問題
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跑CUDA的時候，輸入文件沒有錯，因為其他體系用的同樣的格式。計算結果也顯示的是跑完了。但是在計算RMSD的時候，在一段時間過后突然變成零值。后來在服務器之間傳遞mdcrd文件時，傳遞一段之后，也顯示錯誤。這種情況應該怎么解決呢？我用同樣的輸入文件，對同一個體系跑了兩次，第二次的軌跡文件做RMSD的時候比第一個多跑了5NS，但還是掉到零了。圖中紅色的是第一次跑的RMSD,黑色是第二次跑的。同一個體系，同一個輸入文件。。。。這是為什么呢？怎么解決呢？？？求高手指點啊 wat.jpg |
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2樓2012-11-21 15:19:36
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