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lyp1001木蟲 (小有名氣)
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[求助]
已知N端5個(gè)氨基酸，求高手找到整個(gè)蛋白序列？ 已有1人參與
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已知N端5個(gè)氨基酸，求高手找到整個(gè)蛋白序列？ N端5個(gè)氨基酸為ala-arg-val-gln-phe,整個(gè)蛋白大小為17~20KD.人源或大腸 |
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凌波麗
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【答案】應(yīng)助回帖
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只知道N末端5個(gè)氨基酸序列就像得出全部序列？不可能！ 即使精確鑒定某種已經(jīng)知道序列的蛋白質(zhì)是否存在于樣品中，也不能如此操作！ 如果要鑒定某個(gè)純化的蛋白質(zhì)樣品是否為已知序列的目的蛋白質(zhì)，那么對(duì)于分離生物大分子對(duì)于此種生物大分子進(jìn)行有限酶水解（通常用胰蛋白酶），可以再對(duì)于各個(gè)水解片段進(jìn)行MS測(cè)定相對(duì)分子量；與此同時(shí)，用自動(dòng)測(cè)序儀測(cè)定N末端和C末端各測(cè)定各連續(xù)的15個(gè)氨基酸左右的氨基酸序列，或者對(duì)于此種生物大分子進(jìn)行有限酶水解（水解酶視蛋白質(zhì)的相對(duì)分子量大小而定，不一定用胰蛋白酶，有必要的話可以用兩次不同的水解酶有限水解）后，分別對(duì)于兩個(gè)相鄰的水解片段分別用自動(dòng)測(cè)序儀測(cè)定序列和用MS測(cè)定相對(duì)分子量（對(duì)于同一次有限水解的每一個(gè)蛋白質(zhì)片段只做一次測(cè)定，或者測(cè)序或者做MS測(cè)定相對(duì)分子量），如果這些數(shù)據(jù)都符合數(shù)據(jù)庫(kù)中的與目的蛋白質(zhì)來(lái)源及類型完全相同的蛋白質(zhì)。 |
7樓2014-07-09 11:38:00
wizardfan
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
lyp1001: 金幣+1, 這結(jié)果我自己也知道，不過還是謝謝你！看來(lái)只能通過實(shí)驗(yàn)方法來(lái)確定了 2012-11-27 09:08:02
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
lyp1001: 金幣+1, 這結(jié)果我自己也知道，不過還是謝謝你！看來(lái)只能通過實(shí)驗(yàn)方法來(lái)確定了 2012-11-27 09:08:02
| The sequence (ARVQF) is probably not long enough to do any searching. Also it seems not a tryptic peptide. Sorry, no answer from me for now unless you give more conditions. |
2樓2012-11-26 22:50:46
零123happy
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3樓2012-11-27 17:23:12
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4樓2012-11-28 06:08:00
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