想用MOPAC內(nèi)的AM1法,計(jì)算分子的LUMO(最低分子空軌道的能量),HOMO(最高分子占有軌道的能量),ElcE(電子能量),HF(生成熱),GE(Gibbs能),MR(分子折射率),DPL(分子總體偶極矩),LogP(疏水性參數(shù)),已經(jīng)安裝了mopac2012和chemoffice2004,我的操作是先用chem3D生成分子的mop文件,然后該文件用mopac2012程序打開(kāi),打開(kāi)的過(guò)程中自動(dòng)生成了一個(gè)arc文件和一個(gè)out文件。用記事本打開(kāi)arc文件和out文件可以看到輸出結(jié)果,在這些結(jié)果里面可以找到LUMO.HOMO,ElcE,HF的結(jié)果,但找不到GE,MR,DPL,LogP,現(xiàn)在有以下疑惑1、結(jié)果文件里面顯示的是PM7方法的計(jì)算結(jié)果,怎樣修改方法為AM1法?2在哪里怎樣設(shè)置輸入?yún)?shù),才能再結(jié)果中找到GE,MR,DPL,LogP的結(jié)果呢?3我雙擊打開(kāi)mop文件,但雙擊之后,那個(gè)窗口一閃之后就生成了arc文件和out文件,不知道是否正常,4我點(diǎn)擊mopac2012.exe文件后出現(xiàn)一個(gè)窗口,上面顯示“type in the name of the data set to be run,complete with path,for example:Z:/mydatasets/test.dat"”是不是要先建立一個(gè)dat文件的呢,可以查看他程序默認(rèn)的使用PM7方法的這個(gè)dat文件嗎?我是mopac菜鳥(niǎo),希望大蝦們不吝賜教,說(shuō)些詳細(xì)步驟,謝謝,另外mopac輸入文件格式和輸出文件管理系統(tǒng)的開(kāi)發(fā)這個(gè)文獻(xiàn)我有的,也了解過(guò),但對(duì)于進(jìn)哪里編輯輸入文件搞不懂,最好就是在原有的默認(rèn)的輸入格式里面進(jìn)行修改下。
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生成的arc文件的文本.jpg
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點(diǎn)擊mopac2012exe文件之后出現(xiàn)的頁(yè)面.jpg |