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y1ding鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[資源]
VASP5.3.2大內(nèi)存崩潰的解決方案
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當(dāng)原子數(shù)很多時(shí)，同樣體系，vasp5.2.2或者vasp4.6.38計(jì)算不出問(wèn)題，vasp5.3.2計(jì)算會(huì)遇到大內(nèi)存導(dǎo)致節(jié)點(diǎn)down或段錯(cuò)誤。 原因是vasp5.3.2在第一個(gè)離子步之后，當(dāng)ALGO/=ALL的情況下，會(huì)自作主張的重新生成一下WAVE，而在vasp5.2.2里是沒(méi)有的。 解決辦法： （僅針對(duì)vasp5.3.2，其他版本沒(méi)有測(cè)試） main.F 2636行開(kāi)始 把以下內(nèi)容中涉及 IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN **** ENDIF 的 注釋掉! IF (NSTEP==1) THEN ! IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN ! CALL ALLOCW(WDES,W_F,WTMP,WTMP) ! CALL ALLOCW(WDES,W_G,WTMP,WTMP) ! DEALLOCATE(CHAM, CHF) ! ALLOCATE(CHAM(WDES%NB_TOT,WDES%NB_TOT,WDES%NKPTS,WDES%ISPIN), & ! CHF (WDES%NB_TOT,WDES%NB_TOT,WDES%NKPTS,WDES%ISPIN)) !! ! setup for scf subspace rotation !! INFO%LONESW=.TRUE. !! CALL SETUP_SUBROT_SCF(INFO,WDES,LATT_CUR,GRID,GRIDC,GRID_SOFT,SOFT_TO_C,IO%IU0,IO%IU5,IO%IU6) !! INFO%LONESW=.FALSE. ! ENDIF CALL PEAD_ELMIN( & HAMILTONIAN,KINEDEN, & P,WDES,NONLR_S,NONL_S,W,W_F,W_G,LATT_CUR,LATT_INI, & T_INFO,DYN,INFO,IO,MIX,KPOINTS,SYMM,GRID,GRID_SOFT, & GRIDC,GRIDB,GRIDUS,C_TO_US,B_TO_C,SOFT_TO_C,E, & CHTOT,CHTOTL,DENCOR,CVTOT,CSTRF, & CDIJ,CQIJ,CRHODE,N_MIX_PAW,RHOLM,RHOLM_LAST, & CHDEN,SV,DOS,DOSI,CHF,CHAM,ECONV, & NSTEP,LMDIM,IRDMAX,NEDOS, & TOTEN,EFERMI,LDIMP,LMDIMP) ! IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN ! CALL DEALLOCW(W_F) ! CALL DEALLOCW(W_G) ! DEALLOCATE(CHAM, CHF) ! ALLOCATE(CHAM(1,1,1,1),CHF (1,1,1,1)) ! ENDIF ENDIF PEAD_ELMIN 說(shuō)明： ! This subroutine is called from main.F and takes care of one or all ! of the following: ! ! ) calculate the macroscopic dipole moment in the cell ! ) calculate the SCF and/or non-SCF response to an electric ! field specified through EFIELD_PEAD in the INCAR file ! ) calculate the dielectric tensor excluding and/or ! including local field effects 以上注釋后，僅會(huì)影響如上量的計(jì)算，其它量不影響。 補(bǔ)充說(shuō)明： vasp5.3.2這個(gè)問(wèn)題，用以往網(wǎng)上說(shuō)的 在FFLAGS 選項(xiàng)的賦值中增加 -heap-arrays 64 運(yùn)行的時(shí)候加 ulimit -s unlimited 換用pgi+acml 都是無(wú)法解決的。 [ Last edited by y1ding on 2012-11-30 at 21:17 ] |
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我嘗試了vasp.5.2.11 這樣的方法行不通 Bad Luck。 我的帖子 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=5873476 “VASP 計(jì)算的一個(gè)棘手的難題 ” |
9樓2013-05-22 22:19:29
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