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dreamfly_ykf木蟲 (正式寫手)
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[交流]
dl_poly_4.0與dl_poly_classical的區(qū)別 已有1人參與
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用了一段時(shí)間的dl_poly有了一些感觸，希望與大家討論一下： 1、dl_poly_classical應(yīng)該就是原來的dl_poly_2.20左右的版本，并行核數(shù)不多，體系沒有4.0大。 2、dl_poly_4.0計(jì)算速度比2.20快很多 3、dl_poly_4.0并行編譯必須gcc是4.4以上版本，不然會(huì)出現(xiàn)編譯錯(cuò)誤 4、4.0并行時(shí)候常常會(huì)出現(xiàn)計(jì)算錯(cuò)誤，其將模擬cell內(nèi)分子按照一定方式劃分給每個(gè)process，因此2.20能計(jì)算通過的程序，4.0常常出現(xiàn)錯(cuò)誤，例如計(jì)算一段時(shí)間會(huì)出現(xiàn)下面錯(cuò)誤，但是手冊(cè)里面沒有錯(cuò)誤原因。 *** warning - global constraint number 1 , with particle numbers: 715 & 716 , converges to a length of 41.43 Angstroms with a factor 8.5766E+02 ,contributes towards next error !!! *** 5、并行速度受到link cell的限制，如果小于4，并行效率低，因此體系越大并行效率越好。 以上是個(gè)人見解，因此盡管4.0速度快，可以計(jì)算一些新的東西，但是模擬一般還是用2.20版本的，計(jì)算不容易出現(xiàn)錯(cuò)誤。希望大家一起發(fā)表模擬感受 |
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gswylq
木蟲 (正式寫手)
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2樓2015-11-15 00:29:56
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