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ottolzm木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
求助namd模擬的基礎(chǔ)上同源建模的問(wèn)題！
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| 我的問(wèn)題是：已知T的三級(jí)結(jié)構(gòu)，但是在T的N端添加了4-10個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)未知，因此用namd模擬獲得了10個(gè)氨基酸+T的三級(jí)結(jié)構(gòu)的模擬，之后想利用這個(gè)模擬獲得的三級(jí)結(jié)構(gòu)作為模板，進(jìn)行4-9個(gè)氨基酸+T的三級(jí)結(jié)構(gòu)的模擬，但是在使用swissmodel進(jìn)行automate modelling 的時(shí)候(我選擇模擬所得的10個(gè)氨基酸+T的模擬三級(jí)結(jié)構(gòu)作為模板)，運(yùn)行總是出錯(cuò)；請(qǐng)教一下諸位同行；這個(gè)問(wèn)題該如何解決或者有沒(méi)有其他的同源建模的軟件可以使用？ |
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2樓2012-12-09 15:10:18
ottolzm
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 2850.6
- 散金: 22
- 紅花: 6
- 帖子: 551
- 在線: 311.4小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 630297
- 注冊(cè): 2008-10-19
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 微生物生理與生物化學(xué)
3樓2012-12-09 19:02:53
4樓2012-12-10 08:54:58
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