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summer2771木蟲 (正式寫手)
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[求助]
qPCR怎樣算出2-ΔΔCT值，還有標(biāo)準(zhǔn)差的那種？
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求助，像我這樣的數(shù)據(jù)，怎么能夠在Con和Treat組都得到3個(gè)2-ΔΔCT值啊？ 我自己琢磨著如果都是用treat跟Con比較的話，那等于說從6個(gè)中選2個(gè)出來兩兩比較，不是不止3個(gè)值了嗎？ 雖然2-ΔCT值也能用來比較，但是我還是想用2-ΔΔCT法，請(qǐng)大家指教！不勝感激！ 未命名.jpg |
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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我大致明白你的意思了， 你的意思是，你對(duì)照組有3只老鼠，實(shí)驗(yàn)組有3只老鼠，然后拿這六只老鼠做qPCR，即 對(duì)照組老鼠 1 基因 - 內(nèi)參 = ΔCT1 2 基因 - 內(nèi)參 = ΔCT2 3 基因 - 內(nèi)參 = ΔCT3 這里的三個(gè)ΔCT要取平均值了，重復(fù)的原則不就是讓取均值嗎 為 ΔCT對(duì)照 實(shí)驗(yàn)組老鼠 1 基因 - 內(nèi)參 = ΔCT1 2 基因 - 內(nèi)參 = ΔCT2 3 基因 - 內(nèi)參 = ΔCT3 這里的三個(gè)ΔCT也要取平均值 為 ΔCT實(shí)驗(yàn) 然后進(jìn)行ΔΔCT計(jì)算 對(duì)照 實(shí)驗(yàn) ΔCT對(duì)照 - ΔCT對(duì)照 ΔCT實(shí)驗(yàn) - ΔCT對(duì)照 然后算出以2（E）為base的指數(shù)2^-ΔΔCT 以上僅為個(gè)人見解，不對(duì)請(qǐng)指正啊 |
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8樓2012-12-08 23:34:42
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2樓2012-12-08 20:29:03
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3樓2012-12-08 20:42:43
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4樓2012-12-08 20:52:45
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我知道樣品的ΔCT=Average樣品-Average內(nèi)參，ΔΔCT=ΔCT-Control樣品的ΔCT。但是我的理解是，如上面的數(shù)據(jù) 比如對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組的ΔCT是 1 2 3 對(duì)照組7.27 7.03 7.55 實(shí)驗(yàn)組10.13 10.23 10.56 如果根據(jù)前面的公式，按照實(shí)驗(yàn)組-對(duì)照組的話，那我可以用對(duì)照組的1去減實(shí)驗(yàn)組的1、2、3都可以啊，這就有3個(gè)ΔΔCT值，那再用實(shí)驗(yàn)組的2和3分別去減，就能得到3+3+3個(gè)ΔΔCT值？ |
5樓2012-12-08 21:00:00
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6樓2012-12-08 21:12:42
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7樓2012-12-08 21:39:57
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送鮮花一朵 |
版主，就是您所說的這樣！ 現(xiàn)在就跟前面那個(gè)貼出來的圖一樣，是下面這樣： 實(shí)驗(yàn)組 對(duì)照組 ΔCT1 ΔCT1 ΔCT2 ΔCT2 ΔCT3 ΔCT3 既然ΔΔCT是等于實(shí)驗(yàn)組ΔCT-對(duì)照組ΔCT值，那么我不是可以隨意從實(shí)驗(yàn)組挑出來一個(gè)ΔCT值去減對(duì)照組的ΔCT嗎？不應(yīng)該是您所說的一定要用第1個(gè)實(shí)驗(yàn)組值去減去對(duì)照組值不是嗎？ 如果我說的是對(duì)的，那就會(huì)有3+3+3=9個(gè)ΔΔCT值了。 |
9樓2012-12-08 23:52:12
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10樓2012-12-09 00:20:31
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