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heavennew鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
遺傳進(jìn)化分析OTUs
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| 最近看到很多環(huán)境微生物的文獻(xiàn)中在做遺傳分析的時(shí)候都做了OTUs，不知道為什么要做這個(gè)東西，還有稀釋曲線，希望有高人指教一下，謝謝了！ |
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3樓2012-12-21 12:58:18
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
rainwander: 金幣+3, MicEPI+1, 鼓勵(lì)交流 2012-12-24 19:41:10
rainwander: 金幣+3, MicEPI+1, 鼓勵(lì)交流 2012-12-24 19:41:10
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首先，我必須說我也是剛開始學(xué)習(xí)這方面的知識，最近在整理進(jìn)化樹，一棵系統(tǒng)進(jìn)化樹是由一系列節(jié)點(diǎn)（node）和邊（branch）組成的無環(huán)連通圖（connected acyclic graph）。節(jié)點(diǎn)用來描述分類單元（taxonomic units）（屬、種群、個(gè)體等），而節(jié)點(diǎn)之間的連線代表物種之間的進(jìn)化關(guān)系。樹的節(jié)點(diǎn)又分為內(nèi)部節(jié)點(diǎn)（internal node）和外部節(jié)點(diǎn)（terminal node）。內(nèi)部節(jié)點(diǎn)又稱為分枝點(diǎn)，代表進(jìn)化事件發(fā)生的位置，或代表分類單元進(jìn)化歷程中的祖先，外部結(jié)點(diǎn)代表實(shí)際觀察到的分類單元，又稱操作單元（operational taxonomic unit，OTU）。分類單元可以是物種也可以是序列，對于分子系統(tǒng)發(fā)生樹來說，基本上以核酸序列或蛋白質(zhì)序列作為分類單元。 不知道你能不能看懂 |
8樓2012-12-24 18:25:20
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2樓2012-12-21 12:57:40
4樓2012-12-21 17:41:32
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5樓2012-12-22 19:36:15
6樓2012-12-23 08:13:52
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7樓2012-12-24 13:42:14
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