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3樓: Originally posted by czyzsu at 2012-12-22 20:35:21
1 氣相中優(yōu)化結(jié)構(gòu)，溫度一般都是采用程序默認(rèn)的溫度。
2 溶劑效應(yīng)考慮溫度，應(yīng)該與溶劑測(cè)試時(shí)的溫度一致。
以上溫度在程序里輸入時(shí)都是開爾文溫度，既是多少K。

請(qǐng)問怎樣把溫度加進(jìn)去呢？加到哪里？

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7樓2012-12-23 19:37:51

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6樓: Originally posted by 天下楓葉 at 2012-12-23 18:00:31
正解啊...

請(qǐng)問溫度應(yīng)該加到哪里呢？
另外，我用chem3d把分子式倒入的，請(qǐng)問還需用chem3d上自帶的MM2預(yù)優(yōu)化一下嗎？因?yàn)槲野l(fā)現(xiàn)是否進(jìn)行預(yù)優(yōu)化計(jì)算得到的能量結(jié)果會(huì)有稍微的不同……

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8樓2012-12-23 19:41:31

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5樓: Originally posted by gengle at 2012-12-23 08:05:38
298.15K 為Gaussian默認(rèn)溫度。
計(jì)算時(shí)，可自行設(shè)定所需溫度

你好，我想把一個(gè)問過(guò)的問題再問一遍：請(qǐng)問溫度應(yīng)該加到哪里呢？
另外，我用chem3d把分子式倒入的，請(qǐng)問還需用chem3d上自帶的MM2預(yù)優(yōu)化一下嗎？因?yàn)槲野l(fā)現(xiàn)是否進(jìn)行預(yù)優(yōu)化計(jì)算得到的能量結(jié)果會(huì)有稍微的不同……

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9樓2012-12-23 19:42:39

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【答案】應(yīng)助回帖

計(jì)算中可以設(shè)置溫度和壓力參數(shù).采用Freq=ReadIsotopes 關(guān)鍵詞,并在分子結(jié)構(gòu)
輸入完畢后,輸入?yún)?shù),包括溫度,壓力和同位素
temp pressure [scale]
isotope for atom 1
...
isotope for atom N
溫度單位是K,壓力為大氣壓,同位素采用整數(shù),在計(jì)算時(shí),程序會(huì)采用實(shí)際的值.
比如
400 3.0
12
16
1
1

我覺得不需要預(yù)優(yōu)化。另外，同一個(gè)輸入文件，進(jìn)行兩次計(jì)算得到的數(shù)值也不完全一樣，這是正常的。取能量值時(shí)一定要做FREQ，因?yàn)镕req是在精確Hessian下進(jìn)行的。OPT的結(jié)果因?yàn)槭窃诮艸essian下得到的，可能并不是最穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，所以有時(shí)做Freq時(shí)還要重新優(yōu)化。

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10樓2012-12-23 22:11:01

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