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夏天的娃金蟲 (小有名氣)
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[求助]
兩個(gè)片段對(duì)接幾種不同構(gòu)型優(yōu)化出的能量差多少可認(rèn)為是忽略呢（構(gòu)型上不是差很遠(yuǎn)）
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我想將兩個(gè)片段對(duì)接，優(yōu)化結(jié)構(gòu)，在片段1同一個(gè)原子附近放置片段二，其中構(gòu)型ABC相差很小，都是將片段2放在片段1上方，只是有所旋轉(zhuǎn)，而D是將片段1與片段2的兩個(gè)原子共面，是參照文獻(xiàn)的構(gòu)型建立的（文獻(xiàn)未提供坐標(biāo)）。優(yōu)化后都無虛頻，ABC除了保持一個(gè)基團(tuán)旋轉(zhuǎn)角度不同外，其它相差不遠(yuǎn)，而D與也基本保持它的初始構(gòu)型，SCF能量結(jié)果如下表。在原excel里保留小數(shù)位數(shù)略多，能量相差比較明顯，保留四位小數(shù)的是相差就很小了。在GV里明顯這四個(gè)構(gòu)型不是完全一樣的，原子間距什么的都有點(diǎn)差別。 但是我很疑惑從這樣的情況里應(yīng)該怎樣選其中一個(gè)構(gòu)型呢？ 換算成kJ/mol后，每個(gè)構(gòu)型相差多少可以認(rèn)為忽略不計(jì)呢？  問題有一點(diǎn)弱。。請(qǐng)求批評(píng)指正！ 構(gòu)型能量，及與最小小能量的差值 |
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2樓2012-12-28 09:03:46
夏天的娃
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 14 (小學(xué)生)
- 金幣: 2740.3
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- 在線: 994.8小時(shí)
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- 注冊: 2011-05-25
- 專業(yè): 化工熱力學(xué)和基礎(chǔ)數(shù)據(jù)
3樓2012-12-28 10:06:16
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