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death_snake金蟲 (初入文壇)
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[求助]
求教：如何修改力場參數(shù)
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我用antechamber生成了一個dmf的小分子嘛，然后每次導(dǎo)入leap都要先導(dǎo)入frcmod以及mol2才可以使用，覺得好麻煩。 想問問大家，有沒什么辦法可以把DMF的參數(shù)直接寫入amber的力場參數(shù)里面，以后讀力場的時候就可以直接讀出來。   |
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【答案】應(yīng)助回帖
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death_snake: 金幣+60 2013-01-04 13:02:00
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例如 在 $your_ambertools_path/dat/leap/cmd下的leaprc.gaff文件中添加 loadoff dmf.lib loadamberparams dmf.frcmod 其中將dmf.lib復(fù)制到 $your_ambertools_path/dat/leap/lib文件夾下 將dmf.frcmod復(fù)制到 $your_ambertools_path/dat/leap/parm文件夾下 然后每次你在tleap中l(wèi)eaprc.gaff的時候就會自動導(dǎo)入力場參數(shù)了 |
5樓2013-01-02 08:18:37
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