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cz_rubygd鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[交流]
幫忙看看有關(guān)研究蛋白質(zhì)相互作用的分析方法問(wèn)題
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首先聲明，本人不懂生物學(xué)，所以文獻(xiàn)中有關(guān)實(shí)驗(yàn)方法的起始句不太明白。 1To determine whether the compounds inhibited bromodomain-histone binding we utilized a peptide displacement assay based on AlphaScreen technology. 這句話(huà)中，主要是采用“什么方法？生物的不懂，請(qǐng)給與解釋”測(cè)定化合物抑制溴域蛋白-組氨酸的結(jié)合作用。 2 to investigate the selectivity of these compounds against other bromodomain, we employed a binding assay based on protein stablity shift. 這句話(huà)，依舊是后半句，生物學(xué)的分析方法，不懂，需要各位幫我掃盲。 3 To order to confirm that the dimethylisoxazole moiety was acting as a KAc minic and to elucidate structure-activity profiles for these compounds , we obtained the cocrystal structures of -------. 這句話(huà)就是KAc是啥縮寫(xiě)啊。 另外，有關(guān)對(duì)蛋白抑制作用的坐標(biāo)圖中， Y-坐標(biāo)（RLUs）和X-坐標(biāo)(Dose)分別代表什么含義，圖貼不上去啊。 |
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cz_rubygd: 金幣+4, 謝謝，protein stablity shift是什么情況？ 2013-01-06 22:54:33
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你這篇文章的實(shí)驗(yàn)性非常強(qiáng)，有點(diǎn)像小綜述。涉及的技術(shù)較多， 1. alpha Screen: http://www.proteomebinders.org/meetings/alpbach/talks/Chevet.pdf 2.A bromodomain is a protein domain that recognizes acetylated lysine residues such as those on the N-terminal tails of histones所以是測(cè)定化合物對(duì)Bromodomain活性的抑制作用 3.這是研究蛋白結(jié)構(gòu)性質(zhì)的方法，可以閱讀本文http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21674662 4.第三點(diǎn)，愛(ài)莫能助，縮寫(xiě)太多，而且沒(méi)圖不能判斷 |
2樓2013-01-06 14:15:04
ccharlien
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3. 實(shí)驗(yàn)室里KAc 一般是醋酸鉀的縮寫(xiě)（Potassium acetate），沒(méi)有上下文，不確定 RLUs一般是Relative Luciferase Units的縮寫(xiě) Dose就是試劑的劑量 看起來(lái)是用了一個(gè)報(bào)告基因試驗(yàn)證明劑量對(duì)活性改變的影響 |
3樓2013-01-06 20:57:27
zhang881007
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