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抗癌藥物活性的計算生物學預測系統(tǒng),初步篩選新藥,試試準不準
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癌癥是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌癥死亡的人口超過720萬人。而在中國,每年因癌癥死亡的人口也超過了170萬。因此,開發(fā)新的抗癌藥物是科學界和醫(yī)學界的熱點和難點。但直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物具有花費大、時間長的特點。以小分子為例,現(xiàn)在已知的小分子化合物超過了1000萬個,因此直接采用實驗的方法從這1000萬個化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此建立一個高效、可靠、準確的抗癌藥物的計算生物學篩選系統(tǒng)對發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義。 為了建立抗癌藥物活性的計算生物學預測系統(tǒng),在中國科學院昆明動物研究所生物信息與系統(tǒng)生物學實驗室黃京飛研究員的指導下,李功華博士開發(fā)了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法,并將該算法應用于預測小分子的抗癌活性。通過交叉驗證,其得到的結果令人振奮:其預測的線下面積(AUC)達到了0.878,顯示該算法能很好的預測藥物小分子的抗癌活性。為了使該算法能被不同學科的研究者和醫(yī)藥工作者應用,李功華博士開發(fā)了一個簡便易用的預測抗癌藥物活性的網頁服務器(http://bsb.kiz.ac.cn/CDRUG/) |
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