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Material Studio的Sorption package模擬與實(shí)驗(yàn)不符 請(qǐng)問該怎么調(diào)參數(shù)
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最近在用sorption來做模擬，我做的是Xylene在MOF上吸附的模擬，實(shí)驗(yàn)值得出xylene是可以進(jìn)入孔道被吸附的，但是在模擬中xylene根本進(jìn)不去。請(qǐng)問我該調(diào)什么參數(shù)呢？剛開始學(xué)習(xí)做模擬不熟悉，望各位大俠賜教！ 我做的過程是： 1. Load解出來的MOF晶體cif，然后用Build-Symetry-Supercell 把晶體變成2*2*3的P1格子 2. Load 用MS畫好并clean的p-xylene結(jié)構(gòu) 3. Sorption 計(jì)算部分 所有的參數(shù)我都放在附圖里面了。 4. 計(jì)算信息： Task : Fixed pressure Monte Carlo method : Configurational bias Random number seed : 1307782553 ---- Fixed pressure calculation parameters ---- Equilibration steps : 1000000 Production steps : 10000000 ---- Energy parameters ---- Forcefield : Universal Electrostatic terms: Summation method : Ewald & Group Accuracy : 1e-005 kcal/mol Charge group cutoff : 18.5 A Buffer width : 0.5 A van der Waals terms: Summation method : Atom based Truncation method : Cubic spline Cutoff distance : 18.5 A Spline width : 1 A Buffer width : 0.5 A Sample interval : 25 steps ---- Configurational Bias Monte Carlo method parameters ---- | | Ratio | Amplitude | | | | | |__________________________________________ | Exchange | 3.000 | | | Regrowth | 2.000 | | | Twist | 1.000 | 5 deg | | Rotate | 1.000 | 5 deg | | Translate | 1.000 | 1 A | | Sorbate | Head bias | Torsion | Torsion | | | steps | twisters | bias steps | |________________________________________________________ | p-Xylene | 10 | 0 | | ---- Fixed pressure calculation ---- Framework charge : 0.000 e per cell | Sorbate | Charge | Fugacity | | | | kPa | ________________________________________ | p-Xylene | 0.000 | 101.000 | Temperature : 1.000 K Total Fugacity : 101.000 kPa ---- Monte Carlo steps ---- |Sorbate | Loading | Creation | Destruction| Regrowth | Rotation| Translation|C/D Ratio| | | | steps | steps | steps | steps |Steps | |__________________________________________________________________________ | p-Xylene| 0 | | | | | | | |Accepted| | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |Attempted| | 2142880| 2142520 | 2856647 |1428268 | 142968 | 0 | | Ratio | | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | | ---- Loading ---- | Sorbate | Average | Minimum | Maximum | | | loading | loading | loading | |________________________________________________________ | p-Xylene | 0.000 | 0 | 0 | ---- Isosteric heats ---- | Sorbate | Average | Minimum | Maximum | | | kcal/mol | kcal/mol | kcal/mol | |________________________________________________________ ---- Overall system energies ---- Average total energy : 0.000 kcal/mol 5. 計(jì)算結(jié)果中的Etotal和Loading圖也在附件里。 希望能夠得到牛人指導(dǎo)！在此感激不盡！ Set up.png Energy.png Constraints Properties Job-Controls.png Loading.png Etotal.png |
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9樓2017-06-29 15:29:55
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