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與狼共舞701

金蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 碳素材料與超硬材料

[求助] 怎么向Gridview計(jì)算平臺提交任務(wù) castep

各位蟲友大家好
小弟計(jì)算機(jī)不是很好，想請教大家怎么在學(xué)校的計(jì)算平臺提交任務(wù)，具體如下
1.學(xué)校的計(jì)算平臺是曙光 Gridview 2.5 HPC 版 Linux系統(tǒng)
2.系統(tǒng)的界面和提交作業(yè)的對話窗口界面都在下面的圖中，我有標(biāo)注
3.想請教的問題如下：
1）castep提交任務(wù)需要哪些文件，已會保存任務(wù)，是不是需要.cell 和 .param 以及模型中出現(xiàn)的原子的贗勢，還需要別的文件嗎？請賜教......文件在什么地方。這些需要的文件要放在計(jì)算平臺的什么文件夾里？
2）入圖作業(yè)提交1，需要選擇工作路徑，如圖中高亮部分，這個(gè)路徑是根據(jù)什么選擇的�。恳稽c(diǎn)也不了解；作業(yè)提交圖2，高級參數(shù)的設(shè)置里面節(jié)點(diǎn)數(shù)和路徑選擇怎么選？這個(gè)和腳本里指定的節(jié)點(diǎn)數(shù)不是一樣的嗎？
3）pbs腳本怎么寫，學(xué)校網(wǎng)站給的例子，最后兩條不是很明白
#PBS -l nodes=nodes number
#PBS -N jobname
#PBS -j oe
cd /home/xmin/Project
/usr/local/bin/mpiexec cpi
其中 #PBS -l nodes=nodes number 為指定幾個(gè)節(jié)點(diǎn)計(jì)算.如: nodes=4
#PBS -N jobname 為用戶命名的提交作業(yè)名稱.如: #PBS -N xmin
#PBS -j oe 為結(jié)果和錯誤輸出同文件.如無此項(xiàng)則分別在兩個(gè)文件中.
cd /home/xmin/Project 編譯后的輸出文件所在路徑(從根目錄開始).
/usr/local/bin/mpiexec cpi 為mpiexec所在路徑.
4）優(yōu)化結(jié)構(gòu)和計(jì)算性質(zhì)需要一起提交任務(wù)的話腳本要改寫，這個(gè)腳本又要怎么寫呢？
5）并行計(jì)算怎么提交的，怎么寫腳本
歡迎有經(jīng)驗(yàn)的大俠賜教...小弟先謝過了

作業(yè)提交圖1.jpg

系統(tǒng)界面.jpg

作業(yè)提交圖2.jpg

操作界面.jpg

[ Last edited by 與狼共舞701 on 2013-1-23 at 19:09 ]

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