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杜一一木蟲 (著名寫手)
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請(qǐng)“羊倌 ”來(lái)這里下載1041數(shù)據(jù)！需要在每個(gè)氨基N原子上加一個(gè)H就對(duì)了。謝！
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請(qǐng)“羊倌 ”來(lái)這里下載1041數(shù)據(jù)！需要在每個(gè)氨基N原子上加一個(gè)H就對(duì)了。謝！ 1041.rar是原文件，上次說(shuō)下載不了了。 YG-1041-refined-2013.1.24.rar 是您給修好的，每個(gè)氨基N原子上少了一個(gè)H原子，需要在每個(gè)氨基N原子上加一個(gè)H就對(duì)了。 還得生成H鍵表。謝！  1041.jpg |
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2013-01-25 19:54:56, 3.37 M
2013-01-25 19:55:03, 960.99 K
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2樓2013-01-25 22:04:32
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1.先看看氫對(duì)不對(duì)。 2.這位說(shuō)的好像是對(duì)的。 http://1000eb.com/feb8 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
3樓2013-01-25 22:40:19
杜一一
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送鮮花一朵 |
檢查了，想了想。還有問(wèn)題想請(qǐng)教。1041數(shù)據(jù)中兩個(gè)有機(jī)物： 其中一個(gè)是Hpmt，它本身的氨基N和磺酸基上各有一個(gè)質(zhì)子（見(jiàn)附件Hmpt）磺酸基上的質(zhì)子是脫去了；另一個(gè)是疊氮酸根（也可能是疊氮酸）。 （1）如果是原來(lái)的數(shù)據(jù)，氨基N和疊氮酸根都不加氫原子，這時(shí)Hpmt去掉2個(gè)質(zhì)子顯示-2價(jià)，疊氮酸根是-1價(jià)，則每個(gè)Co的化合價(jià)是+6，這肯定不對(duì)； （2）如果只給氨基N加氫，疊氮酸根不加氫，這時(shí)Hpmt只去掉磺酸基上的質(zhì)子顯示-1價(jià)，疊氮酸根是-1價(jià)，這時(shí)每個(gè)Co的化合價(jià)是+4，這好像也不對(duì)； （3）所以我認(rèn)為最有可能正確的加氫方式是： 給氨基N加氫，給疊氮酸根不配位的那一端N原子加氫（也即給氨基N2、N3和N12、N14，疊氮酸根不配位的那一端N7、N10和N15、N18，見(jiàn)下圖附件），這時(shí)只有Hpmt去掉磺酸基上的質(zhì)子顯示-1價(jià)，這樣每個(gè)Co的化合價(jià)是+2，比較合理。 （4）上次您給的數(shù)據(jù)，給疊氮酸根兩端N原子都加氫了，是不是氨基N原子上的氫原子轉(zhuǎn)移到配位的那一端疊氮酸根的N原子上了？如過(guò)是這樣的話，每個(gè)Co的化合價(jià)也是+2，好像也很合理。但是我沒(méi)有見(jiàn)過(guò)這樣的。 還請(qǐng)您指點(diǎn)迷津。謝謝！ Hpmt.JPG 1041.jpg 1041 加氫的N原子.jpg |
4樓2013-01-26 09:57:31
杜一一
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又查了點(diǎn)資料，發(fā)現(xiàn)疊氮酸根參與配位時(shí)沒(méi)有出現(xiàn)過(guò)結(jié)合質(zhì)子的情況。百度了一下，“N3-離子是一個(gè)似鹵離子，化學(xué)性質(zhì)類似鹵離子，是-1價(jià)” 這樣的話，必須給氨基N2、N3和N12、N14加氫。這時(shí)每個(gè)Co的化合價(jià)是+4。還不行。疊氮酸根不加氫，只有給磺酸基上的S-O鍵長(zhǎng)最長(zhǎng)也即S-O單鍵上的O原子（O2、O6、O9、O11）加氫了。這樣才能保證每個(gè)Co的化合價(jià)是+2。 唉，現(xiàn)在對(duì)于這個(gè)問(wèn)題我也很迷茫。還請(qǐng)您指點(diǎn)迷津。謝謝！ 1041-1.jpg |
5樓2013-01-26 10:47:07
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1.一些幾何鍵異常，可能是由于數(shù)據(jù)質(zhì)量不夠高所致。 2.一些‘錯(cuò)誤’是由于沒(méi)有定溶劑的原因，定溶劑是一件費(fèi)時(shí)間的事情。 http://1000eb.com/ffxm |
6樓2013-01-27 12:42:32
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