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xy656691金蟲 (正式寫手)
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[求助]
幫忙看下NCBI中這個(gè)網(wǎng)頁(yè)吧，對(duì)里面有些內(nèi)容不太懂
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這個(gè)鏈接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... 358&to=24915210，我想查找ARF2這個(gè)基因的cds序列，為什么打開之后，這個(gè)網(wǎng)頁(yè)里面出現(xiàn)了三個(gè)cds,分別是什么意思呢？ [ Last edited by xy656691 on 2013-1-27 at 13:39 ] |
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木蟲 (著名寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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你不管能搜出多少相同或相似序列，你把所有這個(gè)基因的序列都下載下來(lái)，用軟件比對(duì)一下，就可以知道其中具體有什么差別了。 三個(gè)序列，說明有三個(gè)不同的人提交了這個(gè)基因的序列，但至于三個(gè)序列有沒有差別，你要自己比對(duì)，大部分情況可能是核酸序列有少量差異，但蛋白質(zhì)序列沒有差異，也可能蛋白質(zhì)也有差異，你就要認(rèn)真研究下，具體哪個(gè)是正確的。因?yàn)镹CBI是個(gè)一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)，里面的序列都是沒有經(jīng)過專業(yè)核對(duì)的，個(gè)人都可以提交，所以質(zhì)量不是絕對(duì)很高。 要確認(rèn)的話，你可以在某些二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)繼續(xù)搜索。比如nature的antibodypedia。 |
2樓2013-01-27 12:20:15
gyesang
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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你的這個(gè)序列是基因組序列 Arabidopsis thaliana chromosome 5, complete sequence 意思就是擬南芥 5號(hào)染色體 全序列，如果再看右邊，序列只顯示了from: 24910358 to: 24915210 這個(gè)序列對(duì)你要看你那個(gè)ARF2基因序列基本沒有用，你要查ARF2的cds，你應(yīng)該查這個(gè)基因的參考序列，就是NM_開頭的序列號(hào)，在剛才那個(gè)頁(yè)面中，左側(cè)下拉菜單，選 gene ，然后右邊輸入ARF2即可，搜索出來(lái)第一條就是，點(diǎn)擊進(jìn)入新的頁(yè)面，下面就可以找到你該基因的參考序列了 |
3樓2013-01-28 10:48:01
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