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rainson1988銀蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于Implicit ligand sampling的問題！求助！
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最近看了些關(guān)于MD模擬中用Implicit ligand sampling（姑且先翻譯成：隱形配體采樣）求氣體分子在蛋白質(zhì)中遷移路徑的文章，不太能明白所說的方法，網(wǎng)上也找不到具體的教程。始終不明白的主要有以下幾點(diǎn)： 1.文章多次提到隱形配體分子放在每個(gè)grid的網(wǎng)格點(diǎn)上，對(duì)于具體的一個(gè)的體系，這個(gè)網(wǎng)格點(diǎn)是如何生成的？氣體分子如何做成implict配體后放在個(gè)grid point上的？這個(gè)和grid-SMD是一回事嗎？ 2.就是關(guān)于該模擬的configuration文件的設(shè)置和寫法問題，沒有模版，真心不懂��！ 還有很多其他問題，望大牛能給予指點(diǎn)，晚輩感激不盡啊  |
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