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0502114073木蟲 (正式寫手)
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[求助]
請教大家這種構(gòu)型是怎么建出來的
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請教一下,大家看這些圖里的構(gòu)型是怎么建出來的,第一張是優(yōu)化出來的結(jié)構(gòu),第二張是初始的簡圖。比如我想找個復(fù)合物計算,初始的構(gòu)型要怎么建,有沒有什么依據(jù),不會是憑空想的吧。 }Y[OH[MWI)47YS`B`6Z0%}3.jpg I[$3`OF}~02F])[A2(%H{YA.jpg |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
鐵桿木蟲 (正式寫手)
鐵桿木蟲 (正式寫手)
鐵桿木蟲 (正式寫手)
| 其實這種cluster模型一般是根據(jù)經(jīng)驗建模,如果足夠仔細(xì),應(yīng)當(dāng)窮盡可能的構(gòu)象做初始結(jié)構(gòu),然后分別優(yōu)化,得到的能量最低的結(jié)構(gòu)才是global minimum,當(dāng)然能量次低的結(jié)構(gòu)也可以視為亞穩(wěn)態(tài)或中間態(tài)、過渡態(tài)等,根據(jù)你的研究角度而定。 |
木蟲 (正式寫手)
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