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zcf46180新蟲 (初入文壇)
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[求助]
genebank 提交序列時候，要一個 Assembly Method
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genebank 提交序列時候，要一個 Assembly Method ,請問這個Assembly Method具體是什么，一般填什么，亂填了一個，結(jié)果被打回來了。 We have received 5 sequence submission(s) from you with the following information: > Assembly Method :: CAP v. 3 > Sequencing Technology :: 454 If your sequences represent computer-generated mRNA assemblies then they should be resubmitted to the Transcriptome Shotgun Assembly (TSA) database. The complete TSA submission instructions are below. If your sequences are not computationally assembled then please let us know. We will delete your submissions from our database if we do not receive a response from you by Mar 20, 2013. |
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niil
金蟲 (正式寫手)
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- 專業(yè): 生物信息學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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Assembly Method：序列組裝的方法 Sequencing Technology :測序的技術(shù)，如第一代測序，第二代測序 一般提交的基因是基本上是第一代測序得到的序列，通過片段重疊組裝起來的。你填的454平臺是第二代測序平臺，是高通量的分析平臺， 獲得的原始數(shù)據(jù)通過計算機(jī)組裝后得到unigenes，高通量的測序結(jié)果有專門的數(shù)據(jù)庫TSA。 他們是問你的序列是不是 computer-generated mRNA assemblies，如果是的話就得提交到TSA。 這兩兩項不是必填答案。你可以回復(fù)序列不是computer-generated mRNA assemblies。省的麻煩了。 |
2樓2013-03-08 09:50:07
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