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9號(hào)逐夢(mèng)客新蟲 (正式寫手)
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[求助]
microRNA的啟動(dòng)子如何確定及預(yù)測(cè) 已有1人參與
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大家好，我想請(qǐng)問個(gè)問題，就是microRNA的啟動(dòng)子如何確定，比如基因的啟動(dòng)子一般默認(rèn)為前面的2K，但是microRNA的呢？這個(gè)要怎么做？ 還有一個(gè)問題就是大家知道不知道哪里可以預(yù)測(cè)啟動(dòng)子上的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，知道的分享一下吧。謝謝大家了。 |
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 分子生化實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)積累 | miRNA分子生物學(xué)研究 |
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2樓2013-03-13 09:27:30
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3樓2013-03-13 11:32:27
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【答案】應(yīng)助回帖
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正好在看一篇文獻(xiàn)，里面有段供參考：Intergenic miRNAs are transcribed as autonomous units with their own promoter/regulatory region, from RNA Polymerase II or III; about a 50% of intergenic miRNAs are found in close proximity to other miRNAs, forming extended clusters which are transcribed as single polycistronic unit [16]. Intronic miRNAs, residing within protein coding genes or non-coding genes, seem to be transcriptionally related to the expression of their host gene and processed in consequence of the spliceosome formation |
4樓2013-03-13 16:02:35
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5樓2013-03-13 18:32:38
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【答案】應(yīng)助回帖
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啟動(dòng)子在線預(yù)測(cè)網(wǎng)站： http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/ http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ 至于miRNA 的啟動(dòng)子，我最近也想往這方面發(fā)展，有什么問題一起交流哈，我主要做植物。 |
7樓2015-09-20 13:48:09
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