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happiyoung新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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請(qǐng)好心人指教用何種手段測(cè)兩條鏈中堿基有可能出現(xiàn)的互補(bǔ)配對(duì)的情況
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本人菜鳥(niǎo)，現(xiàn)有兩條寡核苷酸鏈AGGCAGTTGAGACGAACATTCCTAAGTCTGAAATTTATCACCCGCCATAGTAGACGTATCACC以及CTTGCTACACGATTCAGACTTAGGAATGTTCGACATGCGAGGGTCCAATACC GACGATTACAG。請(qǐng)問(wèn)哪位好心的大俠能指教我一下，用何種方法何種手段測(cè)這兩條鏈中的堿基有可能出現(xiàn)的堿基互補(bǔ)配對(duì)的情況？請(qǐng)盡量詳盡地描述一下。感激不盡。 |
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myibm369
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【答案】應(yīng)助回帖
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這種情況你可以用NCBI提供的BLAST在線比對(duì)工具，地址：BLAST，采用Align two or more sequences和blastn。 首先輸入你的兩條序列，進(jìn)行比對(duì)。 對(duì)比后的結(jié)果。 里面更多應(yīng)用，你可以自己去了解下，相信對(duì)你會(huì)有更多幫助。 |
2樓2013-03-18 09:56:06
happiyoung
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3樓2013-03-18 10:28:05
happiyoung
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4樓2013-03-18 10:53:35
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silicare: 金幣+5, BioEPI+1, 應(yīng)助指數(shù)+1 2013-03-18 12:13:53
wizardfan: BioEPI-1, 應(yīng)助指數(shù)-1, 沒(méi)有回答樓主的另外一個(gè)問(wèn)題“如何測(cè)這兩條鏈中的堿基有可能出現(xiàn)的堿基互補(bǔ)配對(duì)的情況” 2013-03-19 07:59:49
silicare: 金幣+5, BioEPI+1, 應(yīng)助指數(shù)+1 2013-03-18 12:13:53
wizardfan: BioEPI-1, 應(yīng)助指數(shù)-1, 沒(méi)有回答樓主的另外一個(gè)問(wèn)題“如何測(cè)這兩條鏈中的堿基有可能出現(xiàn)的堿基互補(bǔ)配對(duì)的情況” 2013-03-19 07:59:49
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會(huì)給你所有的匹配結(jié)果，比如我修改下序列，在2里面加上1的兩段反相互補(bǔ)序列，結(jié)果就會(huì)顯示這樣： 另外你說(shuō)的結(jié)果如何分析是什么意思？ |
5樓2013-03-18 11:05:51
wizardfan
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6樓2013-03-19 08:01:02
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