 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2455 | 回復(fù): 10 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿(mǎn)足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
dodou銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
|
[交流]
稀有密碼子
|
||
|
稀有密碼子（轉(zhuǎn)載） 遺傳密碼有64種，但是絕大多數(shù)生物傾向于利用這些密碼子中的一部分。那些被最頻繁利用的稱(chēng)為最佳密碼子(optimal codons)，那些不被經(jīng)常利用的稱(chēng)為稀有或利用率低的密碼子(rare or low-usage codons)。實(shí)際上用做蛋白表達(dá)或生產(chǎn)的每種生物（包括大腸桿菌，酵母，哺乳動(dòng)物細(xì)胞，Pichia，植物細(xì)胞和昆蟲(chóng)細(xì)胞）都表現(xiàn)出某種程度的密碼子利用的差異或偏愛(ài)。大腸桿菌、酵母、果蠅、靈長(zhǎng)類(lèi)等每種生物都有獨(dú)特的8個(gè)密碼子極少被利用。有趣的是，靈長(zhǎng)類(lèi)和酵母有6個(gè)同樣的利用率低的密碼子。大腸桿菌、酵母和果蠅中編碼豐度高的蛋白質(zhì)的基因明顯避免低利用率的密碼子。因此，重組蛋白的表達(dá)可能受密碼子利用的影響（尤其在異源表達(dá)系統(tǒng)中）的事實(shí)并不很奇怪。你的基因利用的密碼子可能不是你正在利用的蛋白生產(chǎn)系統(tǒng)進(jìn)行高水平表達(dá)所偏愛(ài)的密碼子，這種情況是可能的。利用偏愛(ài)密碼子(preferred codons)并避免利用率低的或稀有的密碼子可以合成基因，基因的這種重新設(shè)計(jì)叫密碼子最佳化。 在同源表達(dá)系統(tǒng)中，同較低水平表達(dá)的基因相比，較高表達(dá)的基因可能有很不同的密碼子偏愛(ài)。通過(guò)對(duì)密碼子利用的歸類(lèi)分析，人們可以真正預(yù)測(cè)任何基因在酵母中的表達(dá)水平。在諸如Zea mays的其他生物中，大量高表達(dá)基因強(qiáng)烈偏愛(ài)以G或C結(jié)尾的密碼子。而且，在Dictyostelium中，同低水平表達(dá)的基因比較，高表達(dá)基因有較大數(shù)目的偏愛(ài)密碼子。 在大腸桿菌中表達(dá)哺乳動(dòng)物基因是不可預(yù)測(cè)和具有挑戰(zhàn)的。例如直到最近才實(shí)現(xiàn)了人血紅蛋白的過(guò)表達(dá)。為了達(dá)到血紅蛋白的好的表達(dá)水平，Alpha-球蛋白 cDNA不得不用大腸桿菌偏愛(ài)的密碼子進(jìn)行重新合成。在異源宿主中實(shí)現(xiàn)象血紅蛋白這樣復(fù)雜的蛋白質(zhì)的過(guò)表達(dá)可能需要最佳化密碼子，這些研究者為此提供了令人信服的資料。成簇的低利用率的密碼子抑制了核糖體的運(yùn)動(dòng)，這是基因不能以合適水平表達(dá)的一個(gè)明顯機(jī)制。核糖體翻譯由九個(gè)密碼子組成的信使（含幾個(gè)低利用率密碼子或全部為低利用率密碼子）時(shí)的運(yùn)動(dòng)速度要比翻譯不含低利用率密碼子的同樣長(zhǎng)的信使的速度慢。即使低利用率密碼子簇位于3'端，信使最后也會(huì)被核糖體”擁擠”而損害，核糖體又回到5'端。3'端低利用率密碼子簇的抑制效應(yīng)可以和全部信使都由低利用率密碼子組成的抑制效應(yīng)一樣大。如果低利用率密碼子簇位于5'端，其效應(yīng)是起始核糖體數(shù)目的全面減少，導(dǎo)致蛋白合成中信使的低效率。散在分布的稀有密碼子對(duì)翻譯的效應(yīng)還未很好地研究，但是有證據(jù)表明這種情況的確對(duì)翻譯效率有負(fù)面效應(yīng)。 其他因素也可以影響蛋白表達(dá)，包括使mRNA去穩(wěn)定的序列。重新設(shè)計(jì)合成基因可以去除或改變這些序列，導(dǎo)致高水平表達(dá)。消除稀有密碼子、去除任何去穩(wěn)定序列和利用最佳密碼子的基因的重新設(shè)計(jì)都可能增加蛋白產(chǎn)量，使的蛋白生產(chǎn)更有效和經(jīng)濟(jì)。 不同物種有不同的密碼子偏愛(ài)性，如果外源蛋白中含大量大腸桿菌的稀有密碼子，特別當(dāng)這些稀有密碼子呈連續(xù)分布的時(shí)候，就會(huì)造成蛋白表達(dá)量極低，或者翻譯提前終止。Rosetta™是為了表達(dá)真核蛋白而特別設(shè)計(jì)的，它含有大腸桿菌稀有的密碼子tRNA，包括 AUA，AGG，AGA，CUA，CCC和GGA。它們以氯霉素抗性的質(zhì)粒形式存在。Rosetta系列是來(lái)自BL21lacY1，所以它具有 BL21lacY1的所有特性。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
2026年華南師范大學(xué)歡迎化學(xué)，化工，生物，生醫(yī)工等專(zhuān)業(yè)優(yōu)秀學(xué)子加入！
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
298求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
數(shù)一英一271專(zhuān)碩（085401）求調(diào)劑，可跨
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
295求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0856求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
材料學(xué)碩333求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
299求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿鄭州大學(xué)，080500學(xué)碩，總分317分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
289求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
070305高分子化學(xué)與物理 304分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 搶金幣啦！回帖就可以得到:
-
2026江西科技師范大學(xué)申亮組招碩士研究生
+1/91
-
太原科技大學(xué)材料科學(xué)與工程學(xué)院招收金屬材料類(lèi)博士一名
+1/82
-
南方醫(yī)科大學(xué)中藥學(xué)院 調(diào)劑碩士生一名 中藥學(xué)專(zhuān)業(yè)
+1/82
-
江南大學(xué)招收具有3年海外博后經(jīng)歷的青年教師
+1/80
-
電力全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室雙一流A類(lèi)長(zhǎng)江學(xué)者團(tuán)隊(duì)招2026年全日制博士1名（4月3日截止）
+2/68
-
青島大學(xué)固態(tài)電池研究團(tuán)隊(duì)招收材料、化學(xué)、物理等方向博士研究生
+2/36
-
西華大學(xué)材料學(xué)院表面科學(xué)與工程技術(shù)科研團(tuán)隊(duì)2026年招收研究生
+1/33
-
天津理工大學(xué)國(guó)家杰青王鐵團(tuán)隊(duì)招聘
+1/29
-
雙一流大學(xué)湘潭大學(xué)“化工過(guò)程模擬與強(qiáng)化”國(guó)家地方聯(lián)合工程研究中心招收博士生
+1/17
-
煙臺(tái)大學(xué)先進(jìn)陶瓷方向 招收材料專(zhuān)業(yè)調(diào)劑研究生
+1/11
-
南京醫(yī)科大學(xué)-譚磊課題組-誠(chéng)招博士后
+1/10
-
08工學(xué)英一數(shù)二290 三個(gè)獎(jiǎng)學(xué)金兩個(gè)省三 一個(gè)省創(chuàng)優(yōu)秀結(jié)項(xiàng) B區(qū)求調(diào)劑
+1/10
-
北京石油化工學(xué)院VOCs凈化技術(shù)課題組 招收2026級(jí)碩士調(diào)劑
+1/7
-
歡迎調(diào)劑報(bào)考
+1/6
-
墨爾本大學(xué)伯明翰大學(xué)聯(lián)合全獎(jiǎng)國(guó)際博士生
+1/5
-
三峽大學(xué)材化學(xué)院磷硅精細(xì)化工課題組招收化學(xué)類(lèi)、材料類(lèi)、材料與化工類(lèi)碩士
+1/4
-
0854工學(xué)-電子信息考研-302分求調(diào)劑，接受跨專(zhuān)業(yè)，只求有學(xué)上�。�！ ! ! ! ！
+1/3
-
【博士招生】天津理工大學(xué)國(guó)家杰青王鐵課題組招收2026年博士研究生
+1/2
-
2026南京林業(yè)大學(xué)雙一流建設(shè)高校——化學(xué)工程學(xué)院招收化學(xué)/材料相關(guān)專(zhuān)業(yè)碩士生
+1/2
-
海南師范大學(xué) 孫元元老師團(tuán)隊(duì)招2026級(jí)碩士生2名
+1/1
dodou
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 462.6
- 帖子: 436
- 在線: 117.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1053629
4樓2013-03-18 19:12:53
dodou
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 462.6
- 帖子: 436
- 在線: 117.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1053629
2樓2013-03-18 18:53:54
★
dodou(金幣+1): 謝謝參與
dodou(金幣+1): 謝謝參與
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
10樓2018-07-31 09:18:33
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 085701求調(diào)劑初試286分 +4 | secret0328 2026-03-28 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 壓國(guó)家一區(qū)線，求導(dǎo)師收留，有恩必謝！ +7 | 迷人的哈哈 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +3 | A child 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +7 | 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +12 | PolarBear11 2026-03-26 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +3 | 好好讀書(shū)。 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +7 | 孅華 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 086000調(diào)劑 +3 | 7901117076 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +10 | land xuxu 2026-03-26 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 348求調(diào)劑 +4 | 小懶蟲(chóng)不懶了 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +9 | 小蠟新筆 2026-03-26 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 359求調(diào)劑 +4 | 王了個(gè)楠 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 343求調(diào)劑 +4 | 贈(zèng)我一本書(shū) 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 349求調(diào)劑 +4 | 李木子啊哈哈 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 085602 289分求調(diào)劑
+8
|
WWW西西弗斯 2026-03-24 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料科學(xué)與工程 317求調(diào)劑 +4 | JKSOIID 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求調(diào)劑 +4 | 李李不服輸 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 086003食品工程求調(diào)劑 +6 | 淼淼111 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +4 | 13853210211 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境學(xué)碩288求調(diào)劑 +8 | 皮皮皮123456 2026-03-22 | 8/400 |
|