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machao8405木蟲 (正式寫手)
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[求助]
同一個(gè)名字的miRNA在不同物種當(dāng)中的序列一樣么?
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| 測(cè)序回來(lái)的數(shù)據(jù)一團(tuán)糟,白忙活了將近4個(gè)月。同一個(gè)名字的miRNA不僅在不同的處理當(dāng)中所給出的序列不一樣,而且序列在數(shù)據(jù)庫(kù)中根本找不到。大家說(shuō)有可能是這樣的情況么? |
榮譽(yù)版主 (著名寫手)
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專家經(jīng)驗(yàn): +24 |

木蟲 (正式寫手)
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結(jié)果中他給的有差異顯著的miRNA名字,我從中挑選感興趣的繼續(xù)研究,比如我選擇了miR1166和miR163,他們?cè)趯?duì)照中的序列和處理當(dāng)中的序列不一樣,我曾經(jīng)打電話問(wèn)過(guò),他們說(shuō)不一樣的也是同一miRNA,只不過(guò)他們選擇了樣品中表達(dá)量最高的給出序列。我把這些序列在miRBase中搜索,其中1166沒(méi)有結(jié)果,而163有結(jié)果,但是有5個(gè)堿基錯(cuò)配,5個(gè)的錯(cuò)配數(shù)量啊,那能叫同一個(gè)miRNA么?況且我根據(jù)他提供的miRNA序列設(shè)計(jì)的引物,試驗(yàn)完全做不下去。你覺得是什么狀況呢? |
至尊木蟲 (著名寫手)
金花家族創(chuàng)始人
木蟲 (正式寫手)
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