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推薦：點(diǎn)突變引物設(shè)計(jì)軟件SDM-Assist
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推薦：點(diǎn)突變引物設(shè)計(jì)軟件SDM-Assist 在使用重疊延伸PCR法做點(diǎn)突變時(shí)，大家是否為該如何挑選正確菌落送去測序而煩惱？在這里我推薦一款可以用于重疊延伸PCR法引物設(shè)計(jì)的免費(fèi)軟件SDM-Assist。該軟件最大特點(diǎn)為，在設(shè)計(jì)點(diǎn)突變印務(wù)時(shí)，可以在引物上通過同義突變引入一個(gè)新的酶切位點(diǎn)，這樣在挑選菌落時(shí)，可以通過該酶切位點(diǎn)協(xié)助判斷該菌落所含質(zhì)粒是否正確，值得送去測序。同時(shí)，該軟件操作簡單，只需點(diǎn)擊幾次鼠標(biāo)就可獲得結(jié)果，軟件設(shè)計(jì)引物自動基于Tm, GC含量, 5’及3’末端穩(wěn)定性，二級結(jié)構(gòu)等因素給出評分。此外，所得結(jié)果可以導(dǎo)出為excel或text文件。 該軟件相關(guān)文章已發(fā)表在BMC Bioinformatics SDM-assist software to design site-directed mutagenesis primers introducing "silent" restriction sites Abhijit Karnik, Rucha Karnik and Christopher Grefen BMC Bioinformatics 2013, 14:105 doi:10.1186/1471-2105-14-105 下載鏈接 http://www.psrg.org.uk/sdm-assist.html 該鏈接頁面附有軟件使用說明動畫，如有任何問題，可以與作者聯(lián)系christopher.grefen@glasgow.ac.uk，如果對自己的英文沒有信心，也可直接站內(nèi)信與我聯(lián)系。 軟件界面及相關(guān)論文 Untitled.jpg 論文下載鏈接 http://www.biomedcentral.com/1471-2105/14/105/abstract [ Last edited by starseacow on 2013-3-27 at 02:09 ] |
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15樓2013-03-26 14:15:25
真的挺好 英語不太好 16樓2013-03-26 17:21:43
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jinhx872樓
2013-03-25 06:47
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duanepp3樓
2013-03-25 07:52
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alarace4樓
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tssy7710樓
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dahhs11樓
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