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chaofan0726新蟲 (小有名氣)
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[交流]
用SPSS運(yùn)行IC50的一些問題請(qǐng)教,請(qǐng)高手指點(diǎn) 已有4人參與
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大家好,本人對(duì)合成出來(lái)的一些列藥物進(jìn)行抗癌活性測(cè)試,設(shè)了1000,500,250,125,62.5,31.25μg/ml幾個(gè)梯度,有幾組數(shù)據(jù)用SPSS運(yùn)行后IC50值超過了1000,但在最大劑量時(shí)他的抑制率是58%,根據(jù)抑制率折線圖所得的結(jié)果應(yīng)該是小于1000的。 由于對(duì)生物知識(shí)了解較少,而且重新在做一次很慢反。現(xiàn)在想請(qǐng)教各位:文章中是否可以直接寫運(yùn)行出的數(shù)值還是寫>1000?具體原因是什么?多謝各位了。 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)

木蟲 (小有名氣)
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如果一個(gè)化合物在最大劑量(1000)時(shí)的抑制率是58%,一般咱們會(huì)認(rèn)為它的IC50值應(yīng)該比1000大不了多少,接近1000. 但事實(shí)上IC50值的計(jì)算,除了與“濃度1000時(shí)-抑制率58%”有關(guān)外,還與其它幾個(gè)濃度(500,250,125,62.5,31.25μg/ml)的抑制率有關(guān)。如果500,250μg/ml 的抑制率值很低,則最后計(jì)算的IC50值會(huì)非常大(別看它濃度1000時(shí)-抑制率58%,已經(jīng)接近50%了)。這種情況我遇到過幾次。 有個(gè)建議,我覺得你設(shè)計(jì)的濃度梯度中,最大的濃度設(shè)計(jì)的不高。當(dāng)然,我不清楚你的化合物的分子量,如果分子量是100的話,最大的濃度只有10微摩/毫升。如果分子量是200的話,最大的濃度只有5微摩/毫升。所以濃度上限的設(shè)定值有些小。如果你的濃度上限設(shè)定的再高些,可能那些原來(lái)超出去的IC50會(huì)落在新的濃度范圍里,這樣SPSS計(jì)算的結(jié)果也會(huì)更準(zhǔn)確。 有很多文獻(xiàn)設(shè)定的濃度梯度為100、50、25......微摩/毫升(如果分子量是200的話,即是20000、10000、5000......微克 /毫升) 如果覺得最高濃度值設(shè)計(jì)的太高,可以再降降。 |
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