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452201796鐵桿木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
求助功能基因建庫(kù)OTU劃分 已有1人參與
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小弟最近在做功能基因的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建，一般16S OTU劃分基本都是97%的相似度為標(biāo)準(zhǔn)，功能基因也是如此嗎？ 一般功能基因只是擴(kuò)增了部分片段，我目前有300左右的正確克隆子，按97%的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)劃分OTU有150多個(gè)，這樣龐大的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)根本無(wú)法呈現(xiàn)，翻譯成氨基酸之后建樹(shù)改進(jìn)不大，跪求大俠相助啊，小弟不甚感激！ |
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2012xin
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- 專(zhuān)業(yè): 環(huán)境微生物學(xué)
2樓2014-04-01 10:06:55
452201796
鐵桿木蟲(chóng) (小有名氣)
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97% |
3樓2014-04-01 10:52:12
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