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huyingdamon
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[求助]
求助大家
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| gromacs手冊(cè)貌似看不懂啊,可能剛看會(huì)很吃力,我想請(qǐng)教一下我是不是需要把里面的內(nèi)容基本都弄懂呢,還是大致看下就行,還有看到溫度耦合和壓力耦合,還是不知道什么意思到底。希望大家?guī)蛶臀,謝謝哈…… |
Gromacs |
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫手)
| 如果只是想開(kāi)始進(jìn)行計(jì)算模擬的話,沒(méi)有太大的必要把精力都投入到看手冊(cè)上。手冊(cè)可以當(dāng)成一個(gè)工具書(shū),在有問(wèn)題的時(shí)候去翻一翻,通過(guò)這種方式把問(wèn)題解決了,個(gè)人感覺(jué)比光看手冊(cè)能好點(diǎn)。如果說(shuō)想要徹底把GROMACS弄懂的話就另當(dāng)別論了。 |

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剛?cè)腴T的話,你需要先按照教程走一遍,弄懂gromacs模擬的過(guò)程是怎么樣的,網(wǎng)上還有一個(gè) “GROMACS Introductory Tutorial ”不錯(cuò); 還有“GROMACS_MD_Flowchart.pdf” 和“File Format In Gromacs.pdf” 這三個(gè)資料都不錯(cuò)。 這三個(gè)網(wǎng)上的資料,找到,并且看完,那個(gè)教程做一遍,在做的同時(shí),你需要結(jié)合手冊(cè)搞懂各個(gè)命令的意義,用法,同時(shí)思考如果是你需要做自己的模擬的時(shí)候,你如何來(lái)建立自己的模型,如何修改各個(gè)參數(shù)。 PS,網(wǎng)上還有各位熱心人自己總結(jié)的心得體會(huì),也可以好好理解理解 |
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