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鍋蓋餅金蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
請(qǐng)問(wèn)DSSP文件應(yīng)該怎樣打開(kāi)
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請(qǐng)教各位前輩 現(xiàn)在我從PDB上下載了一個(gè).pdb的文件并已經(jīng)將其轉(zhuǎn)換成為了.dssp文件 現(xiàn)在的問(wèn)題是，這個(gè).dssp文件應(yīng)該使用什么軟件打開(kāi)呢？應(yīng)該如何對(duì)其進(jìn)行分析？ 我想能直接看到二級(jí)結(jié)構(gòu)圖，請(qǐng)問(wèn)又應(yīng)該怎樣操作呢？ 將pdb轉(zhuǎn)換為dssp使用的程序是 dssp-2.0.4-win32.exe 新手有點(diǎn)暈，希望大神指點(diǎn)一二，謝謝 http://jj.www.gaoyang168.com/image1/e7/5a/2172237_1365006556_277.png QQ截圖20130404001007.png http://jj.www.gaoyang168.com/image1/8f/a1/2172237_1365007213_658.png QQ截圖20130404001732.png [ Last edited by 鍋蓋餅 on 2013-4-4 at 00:23 ] |
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http://jj.www.gaoyang168.com/image1/74/47/2172237_1365046135_435.jpg 前輩，請(qǐng)問(wèn)二級(jí)結(jié)構(gòu)是不是這個(gè)？我是將dssp文件用ESPript處理后得到的 0-0-1365041831-esp.600.jpg |
5樓2013-04-04 11:12:25
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是，esprint的確是另外一個(gè)軟件，有本地版。但是一般都是在線(xiàn)的好用，不用安裝。 二級(jí)結(jié)構(gòu)指什么你應(yīng)該知道的，alpha helix和beta sheet都給你標(biāo)出來(lái)啦。比如一共有3個(gè)alpha helix和7個(gè)beta sheet。 |
6樓2013-04-04 17:48:38
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8樓2013-04-04 19:03:59
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9樓2013-04-04 19:07:54
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