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datouwa木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
Polyrate計(jì)算速率常數(shù)的結(jié)果與實(shí)際差的數(shù)量級(jí)太多，怎么辦？
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2013-04-05 21:54:56, 1.12 M
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yongleli
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
datouwa: 金幣+10, ★★★很有幫助, 非常感謝你的回復(fù)！我再好好調(diào)一下參數(shù)！ 2013-04-07 19:53:27
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1.仔細(xì)看文獻(xiàn)，有沒(méi)有用跟文獻(xiàn)一樣的關(guān)鍵字。 2.調(diào)各種參數(shù)，直到計(jì)算結(jié)果收斂。 3.polyrate雖然是Truhlar組里搞出來(lái)的， 用polyrate的達(dá)人卻是這個(gè)西班牙佬: Espinosa-Garcia 多看看他的文章。 |
2樓2013-04-06 09:25:31
yongleli
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【答案】應(yīng)助回帖
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datouwa: 金幣+10, ★★★很有幫助, Thank you very much! 2013-04-07 19:54:01
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另，polyrate的默認(rèn)參數(shù)一般都是不好使的 需要針對(duì)具體的體系調(diào)。 所以，別看它計(jì)算速度快， 一般調(diào)參數(shù)要調(diào)個(gè)一周左右。 建議你建立一個(gè)Excell文檔，列出每種可能的參數(shù)， 然后一遍一遍地run，直到結(jié)果跟實(shí)驗(yàn)值符合為止。 有時(shí)候還需要scale掉TS的頻率。請(qǐng)參考Jingzhi Pu跟Truhlar合寫(xiě)的文章。 |
3樓2013-04-06 09:28:01
sduzhaoyyang
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4樓2013-04-27 10:51:13
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5樓2013-04-27 10:53:10
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