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[求助]
Dmol3計(jì)算周期性體系振動(dòng)頻率時(shí)k點(diǎn)的設(shè)置問題
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本人用Dmol3做過渡態(tài)，當(dāng)時(shí)勾選了frequency，但計(jì)算后outmol里只有 +++ Entering Vibrations Section +++ Message: Entering vibrations section Harmonic frequencies will be computed by finite differences. Number of displacements per atom is: 2 Step size for finite differences is: 0.010000 Bohrs Message: License checkin of MS_dmol successful Message: License checkin of MS_dsolid successful Message: DMol3 job finished successfully 并且，在outmol前端也有 Warning: Input k points are used for computing vibrational frequencies They must contain full non-symmetrized set for vibrations, no check is applied Warning: kpoints file must contain full - non-symmetrized set for vibrations, no check is applied 現(xiàn)在我想單獨(dú)算振動(dòng)頻率，input文件盒kpoint文件如下： # Task parameters Calculate energy Symmetry off Max_memory 2048 # Electronic parameters Spin_polarization unrestricted Charge 0 Basis dnd Pseudopotential none Functional gga(p91) Aux_density octupole Integration_grid fine Occupation thermal 0.0050 Cutoff_Global 5.1000 angstrom Scf_density_convergence 1.0000e-006 Scf_charge_mixing 0.2000 Scf_spin_mixing 0.5000 Scf_iterations 300 Scf_diis 6 pulay # Kpoint definition file (intervals/offset): Kpoints file 1 1 10 0.0000 0.0000 0.0000 g-TS-fre.kpoints # Calculated properties Frequency_analysis on ———————————————————————————— $reciprocal sampling points and weights 0.0000000000 0.0000000000 0.4500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.3500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.2500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.1500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 -0.0500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 -0.1500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 -0.2500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 -0.3500000000 0.1000000000 0.0000000000 0.0000000000 -0.4500000000 0.1000000000 $end 這個(gè)還是算不了，提示語與找過渡態(tài)是一樣，請(qǐng)問所謂full-non-symmetrized是什么？具體怎么添加？ |
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2樓2013-04-07 08:28:43
foreverhaozi
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1639
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- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
3樓2013-04-08 09:42:53
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嗯 謝謝回復(fù) 我檢查過對(duì)稱性，已經(jīng)是P1了,.car和.input文件中也沒有關(guān)于對(duì)稱性的設(shè)置...不過問題應(yīng)該是出在對(duì)稱性，就是不知道怎么改...之前結(jié)構(gòu)優(yōu)化的時(shí)候也遇到一個(gè)對(duì)稱性的問題，在勾選優(yōu)化超胞的前提下，如果不勾symmetry，超胞會(huì)變形，勾上symmetry，會(huì)提示密度矩陣無法對(duì)稱化，然后任務(wù)失敗，可我在自己電腦上勾上symmetry運(yùn)行（服務(wù)器上裝的5.5，自己電腦裝的5.0），卻沒有出現(xiàn)這個(gè)問題...搞不懂... |
4樓2013-04-09 16:56:07
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