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cif中分?jǐn)?shù)占據(jù)和用MS建結(jié)構(gòu)計(jì)算的問題
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| 我最近要做一些計(jì)算的工作，研究對象是MgY4(SiO4)3O這種晶體，在ISCD中查到它的晶格參數(shù)和原子位置，如圖所示，但是沒找到*.cif文件。我在ISCD晶體庫中找了一個(gè)晶格類型和對稱性與之一樣的晶體Cd5(PO4)3OH，然后將其中的原子坐標(biāo)等相關(guān)信息換成了MgY4(SiO4)3O，得到的cif文件在附件中。將這個(gè)cif文件導(dǎo)入到MS中(圖2)發(fā)現(xiàn)，應(yīng)該是Mg原子的地方，圖形中顯示的是Mg(綠色的小球)，但選中之后左下角的詳細(xì)信息欄中卻顯示是一個(gè)Y原子。后來注意到一點(diǎn)，MgY4(SiO4)3O的ISCD數(shù)據(jù)中，這個(gè)位置上Mg和Y是分?jǐn)?shù)占據(jù)的，占據(jù)數(shù)為0.5，那么這種情況我應(yīng)該怎樣確定這個(gè)位置上應(yīng)該放置哪個(gè)原子。還有一個(gè)問題就是化學(xué)式中顯示只包含26個(gè)O原子，但是在這個(gè)元胞中是38個(gè)O原子，這是為什么。對于分?jǐn)?shù)占據(jù)我在小木蟲上找到一些相關(guān)的帖子，有一種叫虛晶近似的方法可以處理，但是因?yàn)槲乙?jì)算的是用其他的一些雜志原子替換Mg和Y，所以需要確定Mg和Y的具體的位置。這里面可能有不少地方我弄錯(cuò)了，我也是第一次接觸到晶體這一塊的知識，所以請高手不吝賜教。謝謝！ |
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2013-04-13 10:55:06, 2.21 K
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