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emanlee木蟲 (小有名氣)
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[求助]
請問如何知道RNA-Seq讀段是否包含adapter接頭
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如何知道RNA-Seq讀段是否包含adaptor？ （1）從 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX025783 下載了NCBI sra的數(shù)據(jù)，不知道該數(shù)據(jù)是否已經(jīng)去除了adaptor？ （2）是不是默認(rèn)情況下，NCBI sra的數(shù)據(jù)都沒有adaptor？ （3）從sra的讀段數(shù)據(jù)就可以判斷是否包含adaptor？比如所有讀段在兩端或一段包含相同的堿基，就認(rèn)為這些是adaptor？ [ Last edited by emanlee on 2013-4-18 at 08:46 ] |
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3樓2013-07-05 11:36:47
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