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83910金蟲 (小有名氣)
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[求助]
SSR跑膠結(jié)果如何確定基因位點以及等位基因數(shù)
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本人是做SSR的新手，跑完膠之后要寫論文了，不過不知道如何根據(jù)跑膠結(jié)果來確定有多少基因位點和等位基因數(shù)，下面是我用兩個引物做出的跑膠結(jié)果，希望前輩們以這兩張圖為例子告訴怎么確認基因位點和等位基因數(shù)，非常感謝 IMG_1822.JPG IMG_1844.JPG |
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berylstone
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★
小丹木木: 金幣+4, 鼓勵積極熱心應(yīng)助 2013-05-29 16:06:02
小丹木木: 金幣+4, 鼓勵積極熱心應(yīng)助 2013-05-29 16:06:02
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一般來說，SSR在一個樣本里只會跑出1-2條帶，雖然也有超多帶的情況，但是是少數(shù)。 因為SSR兩側(cè)的序列照道理是特異的，如果出現(xiàn)很多帶，一般是引物設(shè)計的問題。 其次，會在一條主帶下出現(xiàn)比主帶稍淺的影子帶，有時候不止一條。這也是正常的，很難避免。 樓主需要提供你用來跑微衛(wèi)星的群體是怎樣的？有沒有可能在群體所有樣本中都出現(xiàn)同樣大小的一條帶？ 如果是野生群體，這應(yīng)該不大可能。如果是一個家系，要看父母本的狀況確定。 如果不大可能都出同一條帶，那么下面都出現(xiàn)的帶就是引物設(shè)計帶來的在其他位點擴增出來的帶，而非微衛(wèi)星了。 |
2樓2013-05-29 13:20:57
berylstone
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3樓2013-05-29 13:24:02
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