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zealotxk

銅蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 生物信息學(xué)

[求助] 關(guān)于兩段肽鏈之間的夾角的計(jì)算

在有些論文里看到有關(guān)于兩段肽鏈夾角的描述或者討論，比如：一段alpha螺旋和另一段肽鏈之間的角度隨著MD的進(jìn)行發(fā)生了某些變化。我的疑問是，這樣的角度是怎么得到的？

我對這個(gè)問題的看法是，這種表述本身應(yīng)該就不是一種非常嚴(yán)謹(jǐn)?shù)谋硎�，所以這種角度的描述是否也只是一種粗略描述，并不是很精確？那么在具體測量這個(gè)角度的時(shí)候，是不是也只需要進(jìn)行粗略的估算即可？
比如取肽鏈兩端C原子的連線作為這段肽鏈的近似的軸線，然后計(jì)算兩個(gè)軸線夾角�；蛘卟捎镁_的一點(diǎn)的方法，分別統(tǒng)計(jì)兩段肽鏈中原子分布的幾何中心，擬合出兩根軸線。

希望我已把問題表述清楚了。
我是純新手，請大家不吝賜教。

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1樓 2013-05-03 13:27:42

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