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lijh1234

木蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
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蟲號: 770633
注冊: 2009-05-15
性別: GG
專業(yè): 慢性阻塞性肺疾病

[求助] 過表達(dá)基因序列---腺病毒包裝用

我要做一個基因的過表達(dá)腺病毒包裝，該基因表達(dá)的蛋白為（precursor），在細(xì)胞內(nèi)會被切成N端和C端。但我只想要N端的序列，請問這個怎么查。
我在NCBI上查到了其蛋白的信息，但有些地方不大懂

FEATURES          Location/Qualifiers
   source       1..437
                  /organism="Mus musculus"
                  /strain="C57BL/6"
                  /db_xref="taxon:10090"
                  /chromosome="5"
                  /map="5 14.39 cM"
   Protein       1..437
                  /product="sonic hedgehog protein precursor"
                  /note="sonic hedgehog protein; HHG-1; hemimelic extra
                  toes; short digits"
   sig_peptide    1..24
                  /inference="non-experimental evidence, no additional
                  details recorded"
                  /note="Potential; propagated from UniProtKB/Swiss-Prot
                  (Q62226.2)"
                  /calculated_mol_wt=2530
   mat_peptide    25..437
                  /product="Sonic hedgehog protein"
                  /experiment="experimental evidence, no additional details
                  recorded"
                  /note="propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
                  /calculated_mol_wt=45261
   Region       26..185
                  /region_name="HH_signal"
                  /note="Hedgehog amino-terminal signalling domain;
                  pfam01085"
                  /db_xref="CDD:201590"
   Region       188..423
                  /region_name="Hint"
                  /note="Hint module; pfam01079"
                  /db_xref="CDD:144609"
   Site          198..199
                  /site_type="cleavage"
                  /inference="non-experimental evidence, no additional
                  details recorded"
                  /note="Cleavage, by autolysis (By similarity); propagated
                  from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
   Region       199..349
                  /region_name="Hint"
                  /note="Hedgehog/Intein domain, found in Hedgehog proteins
                  as well as proteins which contain inteins and undergo
                  protein splicing (e.g. DnaB, RIR1-2, GyrA and Pol). In
                  protein splicing an intervening polypeptide sequence - the
                  intein - is excised from a protein; cd00081"
                  /db_xref="CDD:73181"
   Site          order(199,271,348..349)
                  /site_type="other"
                  /note="protein-splicing catalytic site"
                  /db_xref="CDD:73181"
   Site          order(199,268,271)
                  /site_type="other"
                  /note="thioester formation/cholesterol transfer"
                  /db_xref="CDD:73181"
   Site          244
                  /site_type="other"
                  /inference="non-experimental evidence, no additional
                  details recorded"
                  /note="Involved in cholesterol transfer (By similarity);
                  propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
   Site          268
                  /site_type="other"
                  /inference="non-experimental evidence, no additional
                  details recorded"
                  /note="Involved in auto-cleavage (By similarity);
                  propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
   Site          271
                  /site_type="other"
                  /inference="non-experimental evidence, no additional
                  details recorded"
                  /note="Essential for auto-cleavage (By similarity);
                  propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (Q62226.2)"
   CDS          1..437
                  /gene="Shh"
                  /gene_synonym="9530036O11Rik; Dsh; Hhg1; Hx; Hxl3;
                  M100081"
                  /coded_by="NM_009170.3:339..1652"
                  /db_xref="CCDS:CCDS19146.1"
                  /db_xref="GeneID:20423"
                  /db_xref="MGI:98297"
ORIGIN
      1 mllllarcfl vilassllvc pglacgpgrg fgkrrhpkkl tplaykqfip nvaektlgas
   61 gryegkitrn serfkeltpn ynpdiifkde entgadrlmt qrckdklnal aisvmnqwpg
   121 vklrvtegwd edghhseesl hyegravdit tsdrdrskyg mlarlaveag fdwvyyeska
   181 hihcsvkaen svaaksggcf pgsatvhleq ggtklvkdlr pgdrvlaadd qgrllysdfl
   241 tfldrdegak kvfyvietle prerllltaa hllfvaphnd sgptpgpsal fasrvrpgqr
   301 vyvvaerggd rrllpaavhs vtlreeeaga yapltahgti linrvlascy avieehswah
   361 rafapfrlah allaalapar tdgggggsip aaqsatearg aeptagihwy sqllyhigtw
   421 lldsetmhpl gmavkss
//

我在想是不是我標(biāo)紅的那段，就是我想要的N-terminal部分？
是不是把這段直接給公司他們就可以做出來了？

回復(fù)此樓

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1樓 2013-05-03 19:46:46

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