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fustar08木蟲 (小有名氣)
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[求助]
一未知蛋白PMF 肽指紋結(jié)果如何分析呢 有圖，有反應(yīng)條件
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本蟲是做酶工程的，篩到一株細菌得到一純化蛋白，但是不知道該功能，于是聯(lián)系一公司做了PMF測定。但是結(jié)果不知道怎樣分析，也不明白該公司測定得有沒有價值。請各位大俠幫幫忙指點迷津。 目標：通過PMF預(yù)測該未知蛋白大概是個什么蛋白 樣品：細菌發(fā)酵液純化的胞外蛋白 分子量33 KDa（SDS-PAGE測定） 處理：Trypsin酶解 PMF儀器型號：ultraflex tof/tof Bruker 附件：公司測定結(jié)果Mascot比對 問題： 1.PMF結(jié)果在Macsot上比對的結(jié)果顯示最相似的蛋白為threonine dehydratase biosynthetic 1，其余均是些預(yù)測蛋白，但是酶活測定發(fā)現(xiàn)不是該種蛋白。 請問檢測的結(jié)果還可以獲得哪些有用的信息嗎？感覺花錢打了水漂。 2.該菌株的屬有基因組報道，有預(yù)測蛋白，通過自建庫有沒有什么幫助（自建庫的原理我也不是太明白）。 DW20_G71.jpg [ Last edited by fustar08 on 2013-5-3 at 23:32 ] |
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2013-05-03 23:14:03, 162.08 K
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