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linyusuc銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
gromacs關(guān)于能量計算的疑問
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請教各位高手: 對于gromacs中定義的能量vdw1-4和vdw（SR）分別指的是什么 為什么對于單一的一個分子在真空中計算的vdw1-4和100個分子在周期性邊界條件下計算得到的vdw1-4，二者并不是100倍的關(guān)系呢，分子動力學(xué)模擬中所施加的這種周期性邊界條件將會對模擬體系的能量和性質(zhì)有著怎樣的影響呢？另外，對于分子動力學(xué)模擬的可靠性是如何檢驗的，請各位多指點！ |
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