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hk289銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
請(qǐng)教下 多肽的CD測(cè)試結(jié)果如何分析
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近期做了多肽的圓二色譜分析想分析其構(gòu)象在不同條件下的變化。測(cè)量時(shí)以Buffer作為空白并減去得到結(jié)果，有的時(shí)候會(huì)得到的信號(hào)圖形全部在0以下，利用機(jī)子（Jasco J-810 circular dichroism spectropolarimeter）自帶軟件無法解析。可能信躁比太低（因?yàn)槲覍?duì)同一個(gè)樣品連續(xù)測(cè)幾次，結(jié)果不太一樣），這到底怎么回事呢？請(qǐng)指點(diǎn)下。 有的樣品利用機(jī)子自帶的軟件可以分析結(jié)果。這個(gè)程序分析結(jié)果的方法可能就是拿標(biāo)準(zhǔn)的螺旋、折疊、轉(zhuǎn)角和無序曲線與樣品曲線進(jìn)行擬合計(jì)算，然后得出了各個(gè)二級(jí)結(jié)構(gòu)所占的組分，因?yàn)榭椿旧洗蟛糠治墨I(xiàn)設(shè)計(jì)CD圖，都會(huì)根據(jù)圖形直接說這個(gè)是什么構(gòu)象，我分析這個(gè)多肽的構(gòu)象很奇怪，這個(gè)多肽（就10幾個(gè)氨基酸組成）會(huì)形成這4種構(gòu)象全部包括了，應(yīng)該是怎樣去分析這個(gè)得到的曲線？我得到的曲線跟標(biāo)準(zhǔn)的螺旋、折疊、轉(zhuǎn)角和無序曲線差別較大，所以我也不能直接說這個(gè)構(gòu)象就是螺旋或者什么的。麻煩指點(diǎn)下。 謝謝 |
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謝謝你的關(guān)注 1波長(zhǎng)190-260nm 2.HT低于600，190-200nm之間的信號(hào)高于400 3.沒換樣，比色皿位置也沒動(dòng)。測(cè)完得到曲線之后，再測(cè)一次。 4.自己自帶的軟件，名字我還真沒記住，算法應(yīng)該就是拿四個(gè)構(gòu)象（螺旋、折疊、轉(zhuǎn)角和無序）的標(biāo)準(zhǔn)曲線與測(cè)量得到的曲線進(jìn)行擬合計(jì)算，算出哪部分滿足哪種構(gòu)象，會(huì)得到結(jié)果如：helix 20% turn 30% beta 40% random 10%，就是類似這樣的結(jié)果。我現(xiàn)在就是搞不動(dòng)文獻(xiàn)中基本沒提到過這種結(jié)果的，一般就是說曲線表示的是某個(gè)特定的構(gòu)象？我是應(yīng)該關(guān)注這些不同比例中占最大比例的構(gòu)象還是由這些不同的構(gòu)象比例會(huì)告訴我整體的構(gòu)象到底是什么個(gè)東西？ |
4樓2013-05-13 16:38:38
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