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biotianyanan銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助質(zhì)粒大神，小弟初入研門，一件特別糾結(jié)的事情
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我們實(shí)驗室有一N多年前構(gòu)建好的載體，用于植物超表達(dá)的，現(xiàn)在只有序列，圖譜丟失了，我們實(shí)驗室現(xiàn)在的師兄師姐都不做這個，悲催我只能自己搞了。 我會分析酶切位點(diǎn)，卻不知道怎么去找到它的35S強(qiáng)啟動子和Tnos的序列，以及其他成分，比如抗生素序列，望各位師兄師姐能指點(diǎn)小弟，在此感激不盡。 ps：很糾結(jié)啊，用各種質(zhì)粒分析軟件搞好幾天了，ncbi blast也做了，就是無法重建出來圖譜，不太會這個  |
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starseacow
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2樓2013-05-13 04:35:09
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
biotianyanan: 金幣+10, ★★★很有幫助, 幫人者，自有功德無量 2013-05-13 08:49:44
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| 先找一個到多個農(nóng)桿菌質(zhì)粒來比較.首先確定左邊界和右邊界,再確定左右邊界之間T-DNA的各個片段功能,包括ORF,常見的啟動子和終止子.小片段blast有時候不準(zhǔn)確,直接用Vector NTI的搜索功能搜索已經(jīng)確定了圖譜的質(zhì)粒,要容錯幾個堿基,看哪個位置匹配程度高,就是哪個片段. |
3樓2013-05-13 08:07:34
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