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晴空will新蟲 (初入文壇)
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[求助]
基因甲基化
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| 親們呀,剛開始接觸甲基化,完全無從下手呀,有沒有好的建議呀?最好能分享一下學(xué)習(xí)經(jīng)驗,能有材料資源就更好了!新手呀,還不太會玩,見諒呀!謝謝啦! |
新蟲 (初入文壇)
專家顧問 (知名作家)
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專家經(jīng)驗: +218 |
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DNA甲基化的高通量測序的基本方法可以分為兩大類: 1.非質(zhì)譜方法:比如重亞硫酸鹽測序方法檢測DNAde甲基化;甲基化-敏感性單鏈構(gòu)想分析;DNA的甲基化改變的變性梯度膠電泳;DNA的甲基化特異性寡核苷酸生物芯片分析,生物芯片分析也能夠用于DNA測序等等。 2.質(zhì)譜方法:測定DNA甲基化修飾之后的相對分子量變化,MS-MS既可以用測定多肽序列,也可以用于測定寡核苷酸序列,可以在測定甲基化特異性寡核苷酸序列前用限制性內(nèi)切酶切開DNA,不含有修飾的DNA部分可直接用酶法和化學(xué)法測定,剩下的有修飾的部分DNA片段用MS-MS。 參考文獻: 1.MMB 507-DNA methylation,which is one of Methods in Molecular Biology Series.http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6015850 2.John N. Abelson Melvin I. Simon ect .,Method in Enzymology Vol-402,Biological Mass Spectrometry,Elsevier Inc,2005. http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=5795342 DNA甲基化的測序的研究是現(xiàn)在研究的熱點表觀遺傳學(xué)研究中的DNA甲基化的結(jié)構(gòu)和功能影響的第一步,或者說起點,沒有這一步,DNA甲基化(本身就是生命科學(xué)的研究最前沿之一)的生物效應(yīng)只是空中樓閣。DNA甲基化不被認(rèn)為是DNA的堿基序列發(fā)生了改變,即遺傳物質(zhì)未變生物體的表達(dá)性狀卻改變了。 高通量DNA的甲基化測序研究本身也是高通量DNA測序的一個重大進展。DNA的核苷和堿基的修飾種類很多,這些修飾成分都不能用常規(guī)的酶法和化學(xué)法測定。 最好的高通量DNA的修飾成分的測序是質(zhì)譜方法:測定DNA甲基化修飾之后的相對分子量變化,MS-MS既可以用測定多肽序列,也可以用于測定寡核苷酸序列,可以在測定甲基化特異性寡核苷酸序列前用限制性內(nèi)切酶切開DNA,不含有修飾的DNA部分可直接用酶法和化學(xué)法測定,剩下的有修飾的部分DNA片段用MS-MS。目前是需要很大的發(fā)展。 還有一本中文翻譯的MMB系列的表觀遺傳學(xué)實驗手冊。 Trygve O.Tollefsbol 著,吳超群 等譯,表觀遺傳學(xué)實驗手冊,上?萍汲霭嫔纾2007。 你可以看一下,我這里沒有該書電子版。 用我答過的帖子的內(nèi)容回答一下。具體問題可以在討論。 |
專家顧問 (知名作家)
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Methylation: From DNA, RNA and Histones to Diseases and Treatment(2012) http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=5253413 書不錯!參考一下吧。DNA甲基化目前還非常前沿的研究領(lǐng)域。 |
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