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hee_csu

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[求助] QM/MM計(jì)算中如何添加Pb的amber力場(chǎng)參數(shù)？

已經(jīng)有PbS3三配位結(jié)構(gòu)的從頭算結(jié)果，在做金屬蛋白的QMMM模擬時(shí)，如何添加Pb的amber力場(chǎng)參數(shù)？（amber中沒(méi)有Pb的力場(chǎng)參數(shù)）

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今天有點(diǎn)涼

1樓 2013-05-13 17:21:57

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haoguoyu

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hee_csu

2樓2013-05-14 08:21:04

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2樓: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
關(guān)于電荷參數(shù)，把你的構(gòu)型做HF/6-31* 的esp電荷計(jì)算之后，生成amber的resp電荷就是電荷參數(shù)。vdw，鍵長(zhǎng)，鍵角力常數(shù)等需要查。

在高斯QMMM計(jì)算中，具體如何輸入?yún)?shù)，能否給點(diǎn)資料或提示？

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今天有點(diǎn)涼

3樓2013-05-14 10:47:29

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yongleli

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

引用回帖:

Pb的參數(shù)早有人做了，RESP電荷是不好使的～

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4樓2013-05-14 13:07:01

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引用回帖:

4樓: Originally posted by yongleli at 2013-05-14 13:07:01
Pb的參數(shù)早有人做了，RESP電荷是不好使的～...

麻煩蟲(chóng)友提供相關(guān)文獻(xiàn)支持

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今天有點(diǎn)涼

5樓2013-05-14 18:45:56

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今天有點(diǎn)涼

6樓2013-05-20 10:10:01

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4樓: Originally posted by yongleli at 2013-05-14 13:07:01
Pb的參數(shù)早有人做了，RESP電荷是不好使的～...

蟲(chóng)友能否提供“Pb的參數(shù)早有人做了”的相關(guān)文獻(xiàn)，謝謝！

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7樓2013-06-12 09:27:33

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【答案】應(yīng)助回帖

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8樓2013-08-21 21:05:54

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太極夫人

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，計(jì)算完esp電荷后，怎樣生成amber的resp電荷呢？需要什么軟件？謝謝

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9樓2015-04-14 13:24:26

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