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峰回路轉(zhuǎn)1

銀蟲 (初入文壇)

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[交流] 最近用高斯計算a-Fe2o3晶體，總是出現(xiàn)l302.exe錯誤

最近用高斯計算a-Fe2o3晶體，總是出現(xiàn)l302.exe錯誤。應(yīng)該是提示內(nèi)存不夠。我是用的是linux系統(tǒng)6G內(nèi)存的。想問下計算這個構(gòu)型需要多大的內(nèi)存。希望不吝賜教！
%chk=/home/zhang/chk/afe2o3.chk
%mem=1500mw
%nprocshared=4
# opt freq b3lyp/6-31g(d) pbc temperature=293 nosymm

Title Card Required

0 1
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Fe                0.00000000 0.00000000 1.99280840
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Fe                0.00000000 0.00000000 11.77919160
Fe                2.51900000 1.45434533 9.48385827
Fe                2.51900000 1.45434533 6.58347507
Fe                2.51900000 1.45434533 13.46947507
Fe                2.51900000 1.45434533 2.59785827
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O                -1.74843790 3.02838328 10.32900000
O                0.77056210 1.33465271 10.32900000
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O                1.74843790 2.78899804 8.03366667
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O                1.54112420 2.90869066 12.62433333
O                -0.77056210 4.24334336 12.62433333
O                -0.77056210 1.57403795 12.62433333
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1樓 2013-05-14 22:54:54

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峰回路轉(zhuǎn)1

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Symmetry turned off by external request.
Symmetry turned off:
Cannot cope with ghost atoms or with translation vectors.
Stoichiometry Fe12O18
Framework group  C1[X(Fe12O18)]
Deg. of freedom 84
Full point group                C1    NOp 1
Standard basis: 6-31G(d) (6D, 7F)
Integral buffers will be 131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned off.
702 basis functions,  1752 primitive gaussians, 738 cartesian basis functions
228 alpha electrons    228 beta electrons
   nuclear repulsion energy    11621.5473368838 Hartrees.
NAtoms= 30 NActive= 30 NUniq= 30 SFac= 7.50D-01 NAtFMM= 80 NAOKFM=F Big=F
FOutLm=  100.00.
Periodicity:                         1             1             1
Max integer dimensions:             13             13             4
PBC vector 1 X=    9.5204 Y= 0.0000 Z= 0.0000
PBC vector 2 X= -4.7602 Y= 8.2449 Z= 0.0000
PBC vector 3 X=    0.0000 Y= 0.0000 Z= 26.0253
  Recp vector 1 X=    0.1050 Y= 0.0606 Z= 0.0000
  Recp vector 2 X=    0.0000 Y= 0.1213 Z= 0.0000
  Recp vector 3 X=    0.0000 Y= 0.0000 Z= 0.0384
Generated k point mesh (from -Pi to Pi):
K space mesh: X=    28 Y=    28 Z=    10
A half-cell shift: 0
Using k point mesh (from -Pi to Pi):
K space mesh: X=    28 Y=    28 Z=    10
A half-cell shift: 0
CountK=T Total number of k points:    0
CountK=T Total number of k points: 3924
Out-of-memory error in routine STVDrv-2 (IEnd= 2166817603 MxCore=    524288000)
Use %mem=2067MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step.
Error termination via Lnk1e in /home/zhang/g09/l302.exe at Tue May 14 22:46:44 2013.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 40.7 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    32 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1

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2樓2013-05-14 22:58:38

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beefly

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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
峰回路轉(zhuǎn)1: 金幣+1 2013-05-15 11:33:58

內(nèi)存不夠�？闯鲥e信息

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3樓2013-05-15 00:40:58

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引用回帖:

3樓: Originally posted by beefly at 2013-05-15 00:40:58
內(nèi)存不夠�？闯鲥e信息

那請問計算晶體是否必須用pbc,好像很費內(nèi)存嘛？能不能說說主要占內(nèi)存的地方，希望不吝賜教，謝謝

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4樓2013-05-15 11:35:58

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beefly

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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
峰回路轉(zhuǎn)1: 金幣+1 2013-05-15 21:02:10

因為用了雜化泛函，即使換成平面波程序也非常耗時。用純GGA+密度擬合可以降低計算量，但是純GGA計算3d金屬不可靠。不如改用LDA+U方法。

[ Last edited by beefly on 2013-5-16 at 00:48 ]

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5樓2013-05-15 20:09:33

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5樓: Originally posted by beefly at 2013-05-15 20:09:33
因為用了雜化泛函，即換成平面波程序也非常耗時。用純GGA+密度擬合可以降低計算量，但是純GGA計算3d金屬不可靠。不如改用LDA+U方法。

請問計算aFe2O3晶體真的這么耗內(nèi)存嗎？之前看過別人又算68個原子的。我這個才30個。而且1500MW已經(jīng)不小吧？
還有下面的錯誤，希望幫幫忙！！
%chk=/home/zhang/chk/afe2o3.chk
%mem=1500mw
%nprocshared=4
# opt freq b3lyp/6-31g nosymm pbc

Title Card Required

0 1
Fe                0.00000000 0.00000000 4.89319160
O                1.54112420 0.00000000 3.44300000
Fe                0.00000000 0.00000000 1.99280840
Fe                0.00000000 0.00000000 8.87880840
Fe                0.00000000 0.00000000 11.77919160
Fe                2.51900000 1.45434533 9.48385827
Fe                2.51900000 1.45434533 6.58347507
Fe                2.51900000 1.45434533 13.46947507
Fe                2.51900000 1.45434533 2.59785827
Fe                0.00000000 2.90869066 0.30252493
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Fe                0.00000000 2.90869066 4.28814173
Fe                0.00000000 2.90869066 7.18852493
O                -0.77056210 1.33465271 3.44300000
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O                -1.74843790 3.02838328 10.32900000
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O                4.06012420 1.45434533 8.03366667
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O                1.74843790 0.11969262 8.03366667
O                0.97787580 1.45434533 1.14766667
O                3.28956210 0.11969262 1.14766667
O                3.28956210 2.78899804 1.14766667
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O                0.77056210 1.57403795 5.73833333
O                0.77056210 4.24334336 5.73833333
Tv                5.03800000 0.00000000 0.00000000
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Tv                0.00000000 0.00000000 13.77200000
輸出如下
Symmetry turned off:
Cannot cope with ghost atoms or with translation vectors.
Stoichiometry Fe12O18
Framework group  C1[X(Fe12O18)]
Deg. of freedom 84
Full point group                C1    NOp 1
Standard basis: 6-31G (6D, 7F)
Integral buffers will be 131072 words long.
Raffenetti 1 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned off.
510 basis functions,  1524 primitive gaussians, 510 cartesian basis functions
228 alpha electrons    228 beta electrons
   nuclear repulsion energy    11621.5473368838 Hartrees.
NAtoms= 30 NActive= 30 NUniq= 30 SFac= 7.50D-01 NAtFMM= 80 NAOKFM=F Big=F
FOutLm=  100.00.
Periodicity:                         1             1             1
Max integer dimensions:             13             13             4
PBC vector 1 X=    9.5204 Y= 0.0000 Z= 0.0000
PBC vector 2 X= -4.7602 Y= 8.2449 Z= 0.0000
PBC vector 3 X=    0.0000 Y= 0.0000 Z= 26.0253
  Recp vector 1 X=    0.1050 Y= 0.0606 Z= 0.0000
  Recp vector 2 X=    0.0000 Y= 0.1213 Z= 0.0000
  Recp vector 3 X=    0.0000 Y= 0.0000 Z= 0.0384
Generated k point mesh (from -Pi to Pi):
K space mesh: X=    28 Y=    28 Z=    10
A half-cell shift: 0
Using k point mesh (from -Pi to Pi):
K space mesh: X=    28 Y=    28 Z=    10
A half-cell shift: 0
CountK=T Total number of k points:    0
CountK=T Total number of k points: 3924
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis= 510 RedAO= T  NBF= 510
NBsUse= 509 1.00D-06 NBFU= 509
Not enough memory for dipole integrals, short by  3078358905 words.
Harris functional with IExCor=  205 diagonalized for initial guess.
RepCel:  MaxNCR= 1543 NClRep= 1543 NMtPBC= 3973.
HarFok:  IExCor=  205 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=       0 IDoV= 2
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
Dimensions of /B2/ exceeded in AtP2B2.
Error termination via Lnk1e in /home/zhang/g09/l401.exe at Tue May 14 09:35:29 2013.
Job cpu time:  2 days 16 hours 34 minutes 50.7 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=  43483 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1
沒有查到過類似的錯誤，急呀��！

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6樓2013-05-15 21:01:40

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7樓2013-05-16 09:11:20

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sculhf

榮譽版主 (知名作家)

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖

高斯做PBC計算，收斂比較困難，g09可能好些！
沒有用高斯做過晶體計算

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峰回路轉(zhuǎn)1

8樓2013-05-16 22:45:33

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引用回帖:

8樓: Originally posted by sculhf at 2013-05-16 22:45:33
高斯做PBC計算，收斂比較困難，g09可能好些！
沒有用高斯做過晶體計算

謝謝你的回答，

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9樓2013-05-17 13:25:54

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