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請問 trinity拼接如何構建k-mer庫?inchworm選的的種子為什么是出現(xiàn)頻率最高的k-mer
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請問 trinity是如何構建k-mer庫的? 是把read隨即打斷成固定長度段嗎?在inchworm的種子是出現(xiàn)頻率最高的k-mer,指的是最開頭的嗎?不是中間的吧?這個頻率最高是什么意思?為什么要找頻率高的呢? trinity如何解決了轉錄本覆蓋度不均勻等問題? 新手第一次發(fā)帖,大家多支持一下,謝謝啊~ |
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