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fengshuai_木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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求助有關(guān)細(xì)菌菌種鑒定的問(wèn)題
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fengshuai_
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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kx444555: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2013-06-18 21:24:07
fengshuai_: 金幣+10, ★★★★★最佳答案 2013-06-19 08:29:42
kx444555: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2013-06-18 21:24:07
fengshuai_: 金幣+10, ★★★★★最佳答案 2013-06-19 08:29:42
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你好，你可以把序列復(fù)制下來(lái)，與NCBI下載的某菌種16sRNA比對(duì)，觀(guān)察它的正反 NCBI的序列一般是可以看出正反的 16sRNA構(gòu)建樹(shù)的時(shí)候是不需要區(qū)分正反的，軟件（比如MEGA）構(gòu)建樹(shù)的第一步是Align，會(huì)自動(dòng)掉接正反的 |
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fengshuai_3樓2013-06-18 19:30:17
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【答案】應(yīng)助回帖
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fengshuai_: 金幣+20, ★★★很有幫助 2013-06-22 11:17:55
fengshuai_: 金幣+20, ★★★很有幫助 2013-06-22 11:17:55
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剛剛回想了一下，16rRNA是不是不編碼蛋白呢?它好像就是和核糖體蛋白結(jié)合的結(jié)構(gòu)RNA，起到支架的作用，我搜了幾個(gè)序列，用軟件分析都沒(méi)有ORF，應(yīng)該不存在正義反義的問(wèn)題； 關(guān)于畫(huà)進(jìn)化樹(shù)，是不存在正反問(wèn)題的，軟件會(huì)分析，把所有輸入序列方向調(diào)成一樣，所以沒(méi)有問(wèn)題，不知道我的回答你滿(mǎn)不滿(mǎn)意  |
7樓2013-06-21 13:17:27
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