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totoro1992新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
請(qǐng)幫我用pymol做一個(gè)很簡(jiǎn)單的分子疊合吧，菜鳥(niǎo)我做了很久都疊不上
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| 將1BXL的572-586與2BID的85-101疊合�？偸怯芯�啊，疊不上 |
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totoro1992: 金幣+5 2013-05-26 23:30:48
chaizhm: 金幣+1, 謝謝 已經(jīng)簡(jiǎn)單看一遍了 2013-05-27 09:14:37
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6樓2013-05-26 23:04:24
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2013-05-27 09:15:15
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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可以用sybyl定義殘基疊合 Biopolymer--Compare Structures--Fit Monomers 然后分別選擇兩個(gè)蛋白里需要疊合的殘基，記住要一一對(duì)應(yīng)，就是reference molecule里面是572-586依次的順序molecule to fit里面就是85-101依次的順序。 如果你一定要pymol出圖的話把兩個(gè)蛋白merge到同一個(gè)molecular area上然后保存pdb用pymol打開(kāi)就好了 |
2樓2013-05-26 21:15:22
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3樓2013-05-26 21:50:57
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5樓2013-05-26 22:29:43
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7樓2013-05-26 23:14:28
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8樓2013-05-26 23:18:34
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9樓2013-05-26 23:30:36
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10樓2013-05-26 23:39:27
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