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gwzjiayou金蟲 (小有名氣)
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[求助]
自己設(shè)計(jì)RNA建庫用index primer（illumina）PCR擴(kuò)增效率低
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針對(duì)RNA-seq，illumina官方公布的是24種index序列，實(shí)驗(yàn)室用的是NEB的RNA建庫試劑盒，里面也只有24種index，現(xiàn)在這些index不夠用，所以實(shí)驗(yàn)室自己合成了兩個(gè)index primer（序列是根據(jù)small RNA建庫試劑盒的index設(shè)計(jì)的）。 用同樣的樣本建庫，在最后PCR擴(kuò)增時(shí)比較試劑盒index和自合成index primer的擴(kuò)增效率，發(fā)現(xiàn)自合成index primer的擴(kuò)增效率總是很低，實(shí)驗(yàn)方法都一樣，只是6個(gè)堿基的差別（index序列），為什么自合成index primer擴(kuò)增總是低呢？ [ Last edited by gwzjiayou on 2013-6-14 at 15:18 ] |
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gaoyang636
木蟲 (著名寫手)
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2樓2013-06-15 08:40:35
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