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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 綜合其他 » 分子克隆
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zx1990金蟲 (小有名氣)
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[求助]
分子克隆
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| 請問測序公司反饋回來的序列，在你自己找到前后引物得到自己的序列之后，還要經(jīng)過哪些詳細過程，才能建成系統(tǒng)發(fā)育樹，這個過程中分別是要保存成什么格式的文檔？我還想知道.fasta格式的文件是起什么作用的？ |
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
amisking: 金幣+5, 鼓勵發(fā)帖應助！ 2013-06-21 21:00:51
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amisking: 金幣+5, 鼓勵發(fā)帖應助！ 2013-06-21 21:00:51
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第一、找到前后引物得到自己的序列,是為了確定你序列的正確性； 第二、一般來講，構建系統(tǒng)發(fā)育樹需要你對所獲得的序列做堿基飽和性測驗，而現(xiàn)在大家都不怎么重視這一步，直接用軟件來建樹。 第三、對于不擅長建樹的同學或者MM來說，MEGA這個軟件是比較適合你的了，現(xiàn)在這個軟件已經(jīng)更新到5.2版本了，免費的哦，提供郵箱，就可以下載了。 第四、構建進化樹，需要你對所獲得的多條序列進行比對，保存之后，再選擇合適的建樹方法，比如NJ什么的（常用NJ）。 第五、fasta文件是一種文件標準，使用這種格式，一般來說利于軟件識別序列，特別是一個含有多序列的文件。 第六、如果你看完這些還不會的話，可以百度搜索“如何使用MEGA構建進化樹”之類的。 第七、如果還不會，可以站內聯(lián)系我，呵呵，我還是比較樂意幫助妹子同學的 希望可以幫助你，實驗順利哦~~  |
2樓2013-06-21 20:47:23
zx1990
金蟲 (小有名氣)
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3樓2013-06-22 09:01:16
zx19904樓2013-06-29 17:31:38
zx1990
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多謝 5樓2013-06-30 11:46:33
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