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小木蟲論壇-學術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » MS解析化合物
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| 查看: 1117 | 回復(fù): 4 | |||||
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anmin0127至尊木蟲 (知名作家)
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[求助]
MS解析化合物
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| 請問使用MS是不是能解析某種化合物的紫外可見吸收光譜（UV-Vis）呢，現(xiàn)在合成一種化合物，使用實驗測出UV-Vis，想使用MS或者其他軟件解析一下在理論上的UV-Vis，與實驗結(jié)果進行對比，請問MS中哪一個模塊能實現(xiàn)呢？ |
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pigrass
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【答案】應(yīng)助回帖
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anmin0127: 金幣+3, ★★★很有幫助 2013-06-25 14:09:35
anmin0127: 金幣+3, ★★★很有幫助 2013-06-25 14:09:35
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我沒用過這個模塊 我知道的是，分子動力學模擬需要力場，力場會分配電荷，但是有些力場不提供電荷分配，可以用VAMP計算電荷分配，再用力場進行動力學模擬 至于怎么計算紫外吸收光譜 MS Help寫的很清楚 用UV-Vis計算 Setting up a UV-Vis calculation 1. Choose Modules | VAMP | Calculationfrom the menu bar to display the VAMP Calculation dialog. 2. Select the Propertiestab. 3. Check the UV-Vischeckbox. 4. Ensure that you have selected a configuration interaction treatment, i.e., CI typeon the Electronic tabis notset to None. 5. Ensure that you have specified a sufficient number of orbitals to include in the configuration interactioncalculation on the VAMP Electronic Options dialog. When the calculation is complete, you can use the Electronic levelsoptions on the VAMP Analysis dialog to view excitation data for the electronic states of the structure being studied and generate its UV-Vis spectrum. |
4樓2013-06-25 10:56:15
pigrass
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
anmin0127: 金幣+5, ★★★★★最佳答案, 謝謝啊，了解了，我看了一下，應(yīng)該能做出來 2013-06-24 19:29:32
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2013-06-25 09:14:14
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anmin0127: 金幣+5, ★★★★★最佳答案, 謝謝啊，了解了，我看了一下，應(yīng)該能做出來 2013-06-24 19:29:32
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按照MS介紹來說，可以用vamp模塊，但是具體是不是可以用最好參考MS VAMP模塊的help，這個我沒試過 MS. VAMP 半經(jīng)驗的分子軌道程序，適用于有機和無機的分子體系�？煽焖儆嬎惴肿拥亩喾N物理和化學性質(zhì)，其計算的速度和精度介于分子力學方法和量子力學之間。快速的VAMP程序可以為DFT程序提供了良好的初始結(jié)構(gòu)以便進行精確的結(jié)構(gòu)優(yōu)化。經(jīng)DFT優(yōu)化好的結(jié)構(gòu)可以用VAMP來計算各種性質(zhì)和光譜。VAMP中還引入了ZINDO哈密爾敦函數(shù)，可計算包含過渡金屬的有機金屬體系的紫外光譜。VAMP還可以向分子動力學模擬提供參數(shù)。 |
2樓2013-06-24 16:20:41
anmin0127
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3樓2013-06-24 19:37:43
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5樓2013-06-25 14:09:28
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